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A machine learning model for fMRI undergraduate thesis which is modelled after BrainGNN.

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使用说明

代码功能

  • 本代码模型改进自 BrainGNN 与 BrainNetCNN,主要用于分析 fMRI 图像分类。
  • 使用 Hydra 读取本地 ./conf/*.yaml 文件进行项目配置。
  • 使用 Wandb 在线平台记录训练结果。
  • 默认使用自建数据集,兼容Conn组水平结果。
  • 如需自定义请调整 ./data 中的数据与代码。

运行要求

  • 需要在 Wandb 平台注册账号并在本地登录。
  • OS软件要求
    • Python 3.10.10
    • Nvidia Cuda Toolkit 11.7.1
    • Nvidia Cudnn Library 8.5.0
  • 其他 Python 包要求位于 requirements.txt 中,可使用 pip 安装。

运行方法

  • 自定义 ./conf 中的配置。
  • 将输入数据复制入 ./data/ 中新建的 data_type 文件夹中。
  • 训练标签使用 ./data/labels.csv 文件。
  • 运行 _main_.py 文件。
  • 前往 ./log/sys 或者 Wandb 在线平台查看运行结果。

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A machine learning model for fMRI undergraduate thesis which is modelled after BrainGNN.

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