Question: DNA LAB [20190502]

specimen-file

backlog , hur många rack vill vi skanna in före 1juni.

Mål -> 10 rack före 1 juli

1. Rodrigos sälprover, 4 plattor (96 rör per platta) (Mixed Specimen)
2. Rodrigos, papperslåda .... hur gör vi här, ska vi köpa in en mindre skrivare (barkod eller qr-kod) ? (Mixed Specimen)
3. Fortsätta med Mossa (finns redan 1 platta inlagd i systemet) , ca 3-4 plattor.
4. Martin Irestedt, 2plattor - har han kandidater som vi kan flytta till micronic ?
5. InsectBIOM, Andreia och Pjotr -> 1 platta -> (Mixed Specimen)

skrivare -> kryo-papper ... så kan vi frysa ned

---

Fält som är viktiga

1. Genus och Species -> exempelvis 'Racomitrium' och 'lanuginosum'

OM vi har 'voucherID' (tillhör en samling) så kan vi fylla i ett eller flera av fälten

1. Institution Code (position 'CE' i excel-mallen)
2. Permanent Collection Code (position 'CG' i excel-mallen)
3. Catalog Number (position 'CH' i excel-mallen)

Frågor om Specimen-mallen: utgår från 'Collection Code' = 'LARHED'

1. 'Sub ID', är det denna kolumn som knyter ihop specimen- och sample-filen ?
2. 'Other ID:s' eller 'Specimen Identifier' , kan det vara voucherID?

---

Olika grupper ?

Att vissa prov börjar i 'LAB' och övergår sedan till 'Archive'.

1. Lab -> Tillfälligt (även lånematerial), också insect biom-atlas project (kopplas till station Linné), olika forskare
2. Archive -> kopplas till ex. DINA Collection Management
3. CGI

Frågeställning 1 (@TODO , Ingimar & Rodrigo kan båda titta på detta)

hur byter vi grupp ....

1. är det möjligt att byta grupp, exempelvis vi registerar allt på 'LAB', kan detta sedan flyttas till 'Archive' ? 1.1 Möjligt att exportera och ändra värdet på gruppen (från 'LAB' till 'Archive') eller måste man göra på något annat sätt ?

---

Frågeställning 2 : Martin Irested(MI) , mata in metadata (@TODO -> Rodrigo fråga MI .... )

1. utgå ifrån en av MI fåglar.
2. ta all metadata från en fågel av MI:s fåglar .
3. kan vi spara all metadata till seqdb ?

---

Frysar

1. hur ser ordningen ut idag ?

---

Frågeställning 3 (Bold) @TODO Ingimar -> skickar mail

1. hur exporterar vi från SeqDB till Bold
2. kan vi få en beskrivning från AAFC ?

---

Frågeställning 4 ABS

1. ABS dokumnet, du kan ladda upp ett dokumnet per 'sample'

Rodrigo : Kan man ladda upp 1 dokumnet per platta ? alt. en hyperlink (@TODO, Ingimar fråga AAFC, mail)

---

Frågeställning 5

publikt gränssnitt. Nu kan man söka på -> Species = lanuginosum skulle man kunna söka på 'Genus' också ...