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polio-nanopore · Nov 27, 2023 · 8bed2de · 8bed2de
1 parent aad2823
commit 8bed2de
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diff --git a/piranha/data/report.mako b/piranha/data/report.mako
@@ -748,7 +748,7 @@
           </tbody>
         </table>
         <br>
-        <p>*Groups not detected in sequencing run: ${config["composition_not_detected"]}</p>
+        <p>*${LANGUAGE_CONFIG["54"]} ${config["composition_not_detected"]}</p>
         <script type="text/javascript">
           $(document).ready( function () {
               var table = $('#myTable2').DataTable({

diff --git a/piranha/utils/report_config.py b/piranha/utils/report_config.py
@@ -56,7 +56,8 @@
     "50" : "Co-occurrence matrix of Reference and Variant alleles called against",
     "51" : ". This is the percentage of bases that cover those sites in the mapping file that are of a high quality (>13) and that are either the reference allele or the allele of the variant called at that site.",
     "52" : "This report is generated by <strong>piranha</strong>, a software tool developed to help standardise and streamline the analysis of poliovirus sequencing reads. It has been developed by members of the Rambaut group at the University of Edinburgh as part of the Poliovirus Sequencing Consortium. If you have used piranha in your work, please <a href='#citation_box' style='color:#e68781'><strong>cite</strong></a> the software.",
-    "53" : "General citation for Piranha"
+    "53" : "General citation for Piranha",
+    "54" : "Groups not detected in sequencing run:"
 }
 
 # FRENCH REPORT
@@ -116,5 +117,6 @@
     "50" : "Matrice de cooccurrence des allèles de référence et de variante appelée par rapport à la référence",
     "51" : ". Il s'agit du pourcentage de bases qui couvrent les sites du fichier de cartographie qui sont de haute qualité (>13) et qui sont soit l'allèle de référence, soit l'allèle du variant appelé sur ce site.",
     "52" : "Ce rapport est généré par piranha, un outil logiciel développé pour aider à standardiser et rationaliser l'analyse des lectures de séquençage du poliovirus. Il a été développé par des membres du groupe Rambaut de l'Université d'Édimbourg dans le cadre du Poliovirus Sequencing Consortium. Si vous avez utilisé piranha dans votre travail, merci de <a href='#citation_box' style='color:#e68781'><strong>citer</strong></a> le logiciel.",
-    "53" : "Citation générale pour Piranha"
+    "53" : "Citation générale pour Piranha",
+    "54" : "Groupes non détectés dans le séquençage:"
     }