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adding in two new lang dict keys, with info on piranha and how to cit…
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aineniamh committed Oct 25, 2023
1 parent 02b7209 commit 85be6e4
Showing 1 changed file with 7 additions and 3 deletions.
10 changes: 7 additions & 3 deletions piranha/utils/report_config.py
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -54,7 +54,9 @@
"48" : "Export image",
"49" : "snipit plot for queries in",
"50" : "Co-occurrence matrix of Reference and Variant alleles called against",
"51" : ". This is the percentage of bases that cover those sites in the mapping file that are of a high quality (>13) and that are either the reference allele or the allele of the variant called at that site."
"51" : ". This is the percentage of bases that cover those sites in the mapping file that are of a high quality (>13) and that are either the reference allele or the allele of the variant called at that site.",
"52" : "This report is generated by <strong>piranha</strong>, a software tool developed to help standardise and streamline the analysis of poliovirus sequencing reads. It has been developed by members of the Rambaut group at the University of Edinburgh as part of the Poliovirus Sequencing Consortium. If you have used piranha in your work, please <a href='#citation_box' style='color:#e68781'><strong>cite</strong></a> the software.",
"53" : "General citation for Piranha"
}

# FRENCH REPORT
Expand Down Expand Up @@ -112,5 +114,7 @@
"48" : "Exporter une image",
"49" : "Graphique d'extraits pour les requêtes dans",
"50" : "Matrice de cooccurrence des allèles de référence et de variante appelée par rapport à la référence",
"51" : ". Il s'agit du pourcentage de bases qui couvrent les sites du fichier de cartographie qui sont de haute qualité (>13) et qui sont soit l'allèle de référence, soit l'allèle du variant appelé sur ce site."
}
"51" : ". Il s'agit du pourcentage de bases qui couvrent les sites du fichier de cartographie qui sont de haute qualité (>13) et qui sont soit l'allèle de référence, soit l'allèle du variant appelé sur ce site.",
"52" : "Ce rapport est généré par piranha, un outil logiciel développé pour aider à standardiser et rationaliser l'analyse des lectures de séquençage du poliovirus. Il a été développé par des membres du groupe Rambaut de l'Université d'Édimbourg dans le cadre du Poliovirus Sequencing Consortium. Si vous avez utilisé piranha dans votre travail, merci de <a href='#citation_box' style='color:#e68781'><strong>citer</strong></a> le logiciel.",
"53" : "Citation générale pour Piranha"
}

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