Este repositorio contiene la información necesaria para seguir paso a paso los talleres de las sesiones de capacitación llevadas a cabo el 23 de mayo de 2024.
En el taller 1 haremos un breve repaso de lo aprendido durante la primera sesión acerca de los métodos para inferir filogenias, así como los diferentes pasos relacionados a este proceso. Para este objetivo, se utilizará un set de datos correspondiente a los arenavirus del Nuevo Mundo y las reconstrucciones se harán mediante el programa IQTree.
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Para el taller #2 haremos una exploración a fondo de los métodos Bayesianos de inferencia filogenética con la finalidad de poder extrapolar estos métodos a la vigilancia de patógenos de importancia en salud pública. Para este objetivo, analizaremos las secuencias de H1N1 de la pandemia del 2009 en Estados Unidos para estimar el tiempo de origen de la epidemia usando BEAST2.
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