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v1.0.0

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@yomichi yomichi released this 30 Apr 12:34
· 741 commits to develop since this release

Release note

[ 日本語 / Eng ]
abics-v1.0.0.tar.gzにはマニュアルのpdfファイルが入っています。"Source code"ではなくこちらのファイルをダウンロードしてください。

更新情報 (from v0.1)

  • メインスクリプト abics
    • 構造最適化機能の追加
    • 前回の結果を引き継いでモンテカルロ計算を続行する機能 (reload) の追加
    • 構造を引き継ぎながら複数のbaseinput ファイルのもとで順番にソルバーを実行する機能 (multistep) の追加
  • ライブラリ
    • docstring (API リファレンス) の追加
    • ユニットテストの追加
    • リスタート時に、前回の最後の構造についてもう一度計算しているバグを修正
    • ソルバーにOpenMXを追加
    • QE について、CPU プロセスの分割のやり方を入力ファイルで指定する機能の追加
  • 補助ツール
    • VASP の座標ファイル (POSCAR) や CIF ファイルから abICS の座標データを生成するツール st2abics を追加
    • レプリカごとの計算結果から温度ごとの計算結果を生成する後処理ツール abicsRXsepT を追加

更新情報 (from v1.0-beta)

  • メインスクリプト
    • 構造を引き継ぎながら baseinput ファイルを複数回回す機能 (multistep) の追加
    • QE について、CPU プロセスの分割のやり方を入力ファイルで指定する機能の追加
  • ライブラリ
    • 構造最適化において、固定する原子・座標に関しては perturb しないように変更
    • seldyn使用時にリスタート機能でエラー終了するバグを修正 (リスタート時に前回の最後の構造を再計算していた処理をスキップするように変更)。
  • 補助ツール
    • VASP の座標ファイル (POSCAR) や CIF ファイルから abICS の座標データを生成するツール st2abics を追加
    • レプリカごとの計算結果から温度ごとの計算結果を生成する後処理ツール abicsRXsepT を追加

Forum (GitHub issue)

Release note

[ 日本語 / Eng ]
Please download abics-v1.0.0.tar.gz (not "Source code") because this file contains manual-pdf files

What's new (from v0.1)

  • Main script abics
    • new feature
      • Structure optimization
      • Reload the structure and temperature of the last step of the last simulation, and restart Monte Carlo sampling (reload)
      • Sequentially invoke the solver using multiple baseinput files while inheriting the structure(multistep)
  • Library
    • OpenMX is now supported
    • For QE, how to split CPU cores is now specified (so-called parallel levels)
    • A bug that on reload the first structure of the second simulation was the same as the last structure of the first simulation is fixed
    • Docstrings (API reference) are added
    • Unittests are added
  • Utility tools
    • st2abics is added
      • A tool for converting a structure file such as POSCAR and CIF file to the structure data for abICS
    • abicsRXsepT is added
      • A tool for generating the result for each temperature from the result of each replica

What's new (from v1.0-beta)

  • Main script abics
    • Sequentially invoke the solver using multiple baseinput files while inheriting the structure(multistep)
  • Library
    • For QE, how to split CPU cores is now specified (so-called parallel levels)
    • Now perturb only coordinates to be optimized
      • Fixed an error termination bug of the restart calculation using seldyn (changed to skip the process of recalculating the previous last structure when restarting).
  • Utility tools
    • st2abics is added
      • A tool for converting a structure file such as POSCAR and CIF file to the structure data for abICS
    • abicsRXsepT is added
      • A tool for generating the result for each temperature from the result of each replica

Forum (GitHub issue)