Evidence denních dat z krajských hygienických stanic, COVID-19

Tento kód slouží ke třem účelům:

• automatický robot, který vytváří screenshoty a převádí data z webů KHS do tabulky COVID-19 po okresech, KHS
• každodenní záloha screenshotů všech 14 krajských hygienických stanic
• měsíční záloha Google Spreadsheet se všemi daty

Data

⚠️ Všechna data jsou dostupná na Google Spreadsheet COVID-19 po okresech, KHS, případně na zkráceném odkazu:

https://www.sablatura.info/covid/data/khs 

Zdroje dat

kraj	url
Jihočeský kraj	khscb.cz
Jihomoravský kraj	khsbrno.cz
Karlovarský kraj	khskv.cz
Kraj Vysočina	khsjih.cz
Královéhradecký kraj	khshk.cz
Liberecký kraj	khslbc.cz
Moravskoslezský kraj	khsova.cz
Olomoucký kraj	khsolc.cz
Pardubický kraj	khspce.cz
Plzeňský kraj	khsplzen.cz
Praha	hygpraha.cz
Středočeský kraj	khsstc.cz
Ústecký kraj	khsusti.cz
Zlínský kraj	khszlin.cz

Postup sběru dat

Většinu dat sbírá robot (web crawler) automaticky. Každý den jej několikrát spustím, data se stáhnou z webů, automaticky vyčistí a nahrajou na list Crawl: dnes. Finální crawl dělám na konci dne, typicky mezi 22 a 2 hodinou ranní. Poté data ručně kontroluji, opravuji chyby OCR a některá data dopisuji.

Počty z KHS jsou verifikované, tedy trochu nižší, než standardně zveřejňuje Ministerstvo zdravotnictví. To je proto, že evidují data zaslaná z laboratoří přímo na ISIN, KHS ale následně přebírají data z ISIN a kontrolují (a pak zveřejňují na webu). A pak taky netrpí tím, že by byly o 7-11 dní zpožděné.

Použité technologie

• Tesseract.js, umělá inteligence natrénovaná pro čtení dat z Ostravy, Plzně a Zlína (bohužel dodávají data jako obrázek)
• Puppeteer (konzolová verze Chrome), který bleskurychle prochází web
• PDFreader, který exportuje texty z PDF a jejich pozice
• Express server, který přes pdf.js generuje z PDF obrázky pro použití v OCR (bohužel neexistuje stabilnější node.js řešení bez nutnosti přepsat celé pdf.js od Mozilly)
• Sharp, bleskurychlé modifikace obrázků pro účely OCR

Pozor, celé repo má více než 3 GB, samotný zdrojový kód pak cca 500 MB.

Při vývoji zemřely tisíce subverzí umělé inteligence. Zvláště ty, které nedokázaly rozlišit mezi 6 a 8. Nechť je jim křemíkové nebe lehké. Pokud znáte Sarah Connorovou, možná budu potřebovat číslo.

Kontakt a další

• Web: sablatura.info
• Email: [email protected]
• FB: Messenger

Moje další COVID-19 API lze nalézt na COVID API.