The directory structure should be something similar to this:
TestingComponentsDeletion ├── README.md ├── config │ └── project-scratch-def.json ├── force-app │ └── main │ └── default │ ├── applications │ ├── aura │ ├── classes │ ├── contentassets │ ├── flexipages │ ├── layouts │ ├── lwc │ ├── objects │ ├── permissionsets │ ├── staticresources │ ├── tabs │ └── triggers ├── jest.config.js ├── package.json ├── scripts │ ├── apex │ │ └── hello.apex │ └── soql │ └── account.soql └── sfdx-project.json
https://alberto-mata.medium.com/removing-deprecated-metadata-using-the-salesforce-cli-e434c268f257