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Revert "Added regrowth move to input files."
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This reverts commit 4538c52.
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Younes Nejahi committed May 7, 2018
1 parent 4538c52 commit e3727d4
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Showing 39 changed files with 74,854 additions and 106 deletions.
9 changes: 4 additions & 5 deletions GCMC/CC3_Xe_adsorption/in.conf
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -7,12 +7,12 @@
############################################################################

#########################
# enable
# enable, step
#########################
Restart false

####################################
# kind {RANDOM, INTSEED}
# kind {RESTART, RANDOM, INTSEED}
####################################
PRNG RANDOM

Expand Down Expand Up @@ -70,11 +70,10 @@ AdjSteps 1000
################################
# MOVE FREQUENCY
################################
DisFreq 0.233
DisFreq 0.333
RotFreq 0.0
IntraSwapFreq 0.233
IntraSwapFreq 0.333
SwapFreq 0.334
RegrowthFreq 0.20


################################
Expand Down
7 changes: 3 additions & 4 deletions GCMC/DME/run2a_bridge/in.conf
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -14,12 +14,12 @@
############################################################################

#########################
# enable
# enable, step
#########################
Restart false

####################################
# kind {RANDOM, INTSEED}
# kind {RESTART, RANDOM, INTSEED}
####################################
PRNG RANDOM

Expand Down Expand Up @@ -87,8 +87,7 @@ AdjSteps 1000
################################
DisFreq 0.2
RotFreq 0.2
SwapFreq 0.4
RegrowthFreq 0.20
SwapFreq 0.6


################################
Expand Down
8,138 changes: 8,138 additions & 0 deletions GCMC/MFI_CH4_adsorption/START_MFI.pdb

Large diffs are not rendered by default.

9,188 changes: 9,188 additions & 0 deletions GCMC/MFI_CH4_adsorption/START_MFI.psf

Large diffs are not rendered by default.

1,002 changes: 1,002 additions & 0 deletions GCMC/MFI_CH4_adsorption/START_Resv_BOX_1.pdb

Large diffs are not rendered by default.

1,158 changes: 1,158 additions & 0 deletions GCMC/MFI_CH4_adsorption/START_Resv_BOX_1.psf

Large diffs are not rendered by default.

150 changes: 150 additions & 0 deletions GCMC/MFI_CH4_adsorption/in.conf
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,150 @@
########################
## Init File
##
## IMPROVEMENTS
## - Compacts inputs into one line
## - Suggestion: edit inline with (insert key)
##
## To-Do
## (make editor + XML version)
########################

############################################################################
# ========-------------------- INPUT --------------------------===========
############################################################################

#########################
# enable, step
#########################
Restart false

####################################
# kind {RESTART, RANDOM, INTSEED}
####################################
PRNG RANDOM

####################################
# FORCE FIELD
####################################
ParaTypeEXOTIC true
Parameters ../../common/Par_MFI_CO2_CH4_Exotic.inp

####################################
# INPUT PDB FILES
####################################
Coordinates 0 ./START_MFI.pdb
Coordinates 1 ./START_Resv_BOX_1.pdb

####################################
# INPUT PSF FILES
####################################
Structure 0 ./START_MFI.psf
Structure 1 ./START_Resv_BOX_1.psf

############################################################################
# =======--------------------- SYSTEM --------------------------===========
############################################################################

##################################
# GEMC TYPE (DEFULT IS NVT_GEMC)
##################################


#############################
# SIMULATION CONDITION
#############################
Temperature 300.00
Potential VDW
LRC true
Rcut 13
Exclude 1-4

#############################
# ELECTROSTATIC
#############################
Ewald false
ElectroStatic false

###############################
# PRESSURE CALCULATION
################################
PressureCalc false

################################
# STEPS
################################
RunSteps 1000000
EqSteps 100000
AdjSteps 1000

################################
# MOVE FREQUENCY
################################
DisFreq 0.20
RotFreq 0.10
SwapFreq 0.50
IntraSwapFreq 0.20

################################
# BOX DIMENSION #, X, Y, Z
################################
CellBasisVector1 0 60.42 0.00 0.00
CellBasisVector2 0 0.00 59.76 0.00
CellBasisVector3 0 0.00 0.00 40.26

CellBasisVector1 1 60.00 0.00 0.00
CellBasisVector2 1 0.00 60.00 0.00
CellBasisVector3 1 0.00 0.00 60.00


##############################
# CBMC TRIALS
##############################
CBMC_First 10
CBMC_Nth 4
CBMC_Ang 100
CBMC_Dih 10

####################################
# Mol. Name Chem. Pot.
####################################
Fugacity C1P 5.00
Fugacity Si 000
Fugacity O 000

############################################################################
# =======-------------------- OUTPUT --------------------------===========
############################################################################

##########################
# statistics filename add
##########################
OutputName CH4_5_bar

#####################################
# enable, frequency
#####################################
CoordinatesFreq true 1000000
RestartFreq true 1000000
ConsoleFreq true 100000
BlockAverageFreq true 100000
HistogramFreq false


################################
# OutHistSettings
################################
DistName dis
HistName his
RunNumber 1
RunLetter a
SampleFreq 200

##################################
# enable: blk avg., fluct.
##################################
OutEnergy true true
OutPressure false false
OutMolNum true true
OutDensity false false

11 changes: 11 additions & 0 deletions GCMC/MFI_CH4_adsorption/output_example/Blk_CH4_5_bar_BOX_0.dat
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,11 @@
#STEPS TOT_EN EN_INTER EN_TC EN_INTRA(B) EN_INTRA(NB) EN_ELECT EN_REAL EN_RECIP TOT_MOL MOLFRACT_O MOLFRACT_Si MOLFRACT_C1P
100000 9999999999 9999999999 -55404.2701 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8420.1590 0.65845005 0.30784677 0.03370318
200000 9999999999 9999999999 -57131.7582 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8454.2129 0.65576843 0.30659303 0.03763854
300000 9999999999 9999999999 -57445.0318 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8460.2227 0.65530272 0.30637530 0.03832199
400000 9999999999 9999999999 -57638.6612 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8463.9424 0.65501424 0.30624042 0.03874534
500000 9999999999 9999999999 -57357.4646 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8458.5531 0.65543163 0.30643557 0.03813280
600000 9999999999 9999999999 -57786.9390 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8466.7752 0.65479526 0.30613804 0.03906670
700000 9999999999 9999999999 -57916.6997 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8469.2476 0.65460443 0.30604882 0.03934675
800000 9999999999 9999999999 -57925.9837 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8469.4359 0.65458938 0.30604179 0.03936884
900000 9999999999 9999999999 -57599.5576 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8463.1791 0.65507399 0.30626836 0.03865766
1000000 9999999999 9999999999 -57448.7196 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 8460.3026 0.65529611 0.30637221 0.03833168
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