Alguns pontos:

1. Os arquivos ainda estão sendo salvos com os nomes originais do download. Como é o selenium que baixa o arquivo, eu não tenho acesso a ele no código durante o download. Talvez uma alternativa seja ler e renomear os arquivos, assim que são baixados. Mas isso deve ser feito em outro PR.

Você pode usar os.rename

2. O diretório de download também é um ponto a ser discutido, rodando localmente o máximo que consigo é setar um caminho pra o diretório do projeto, mas isso inclui toda a rota de pastas do meu dispositivo, não funcionaria em algum outro. Penso que quando for rodar com o docker isso seja solucionado.

A variável de ambiente OUTPUT_FOLDER deve ser quem dita onde os arquivos devem ir. Você tem acesso a variáveis de ambiente via os.environ. Você deve mover os arquivos para este diretório após download. Mas isso deve ser feito em outro PR.

3. O selenium usa um arquivo chamado chromedriver pra simular a navegação, esse arquivo deve ser compatível com o navegador chrome que estiver instalado, e o caminho ao chromedriver também deve ser disponibilizado no código, se repete o problema do ponto 2, com acréscimo da questão da compatibilidade de versão. Mais uma vez acredito que o docker resolve isso.

Exatamente. O Dockerfile que vai vir numa outra PR deve instalar o chrome e já baixar o chromedriver correto.