From f83086dccb2fe40f907b830daa33508549174f63 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vijini Mallawaarachchi Date: Thu, 29 Feb 2024 16:12:46 +1030 Subject: [PATCH] REL: update version number --- phables/phables.VERSION | 2 +- phables/workflow/scripts/phables.py | 2 +- phables/workflow/scripts/phables_utils/FD_Inexact.py | 2 +- phables/workflow/scripts/phables_utils/edge_graph_utils.py | 2 +- phables/workflow/scripts/phables_utils/long_utils.py | 2 +- phables/workflow/scripts/phables_utils/output_utils.py | 2 +- phables/workflow/scripts/phables_utils/short_utils.py | 2 +- 7 files changed, 7 insertions(+), 7 deletions(-) diff --git a/phables/phables.VERSION b/phables/phables.VERSION index 589268e..6261a05 100644 --- a/phables/phables.VERSION +++ b/phables/phables.VERSION @@ -1 +1 @@ -1.3.0 \ No newline at end of file +1.3.1 \ No newline at end of file diff --git a/phables/workflow/scripts/phables.py b/phables/workflow/scripts/phables.py index 353b596..64400d1 100755 --- a/phables/workflow/scripts/phables.py +++ b/phables/workflow/scripts/phables.py @@ -26,7 +26,7 @@ __author__ = "Vijini Mallawaarachchi" __copyright__ = "Copyright 2022, Phables Project" __license__ = "MIT" -__version__ = "1.3.0" +__version__ = "1.3.1" __maintainer__ = "Vijini Mallawaarachchi" __email__ = "viji.mallawaarachchi@gmail.com" __status__ = "Stable Release" diff --git a/phables/workflow/scripts/phables_utils/FD_Inexact.py b/phables/workflow/scripts/phables_utils/FD_Inexact.py index 8cdc1bd..d3dd577 100644 --- a/phables/workflow/scripts/phables_utils/FD_Inexact.py +++ b/phables/workflow/scripts/phables_utils/FD_Inexact.py @@ -6,7 +6,7 @@ import networkx as nx # create logger -logger = logging.getLogger("phables 1.3.0") +logger = logging.getLogger("phables 1.3.1") def read_input(graphfile, number_subpath): diff --git a/phables/workflow/scripts/phables_utils/edge_graph_utils.py b/phables/workflow/scripts/phables_utils/edge_graph_utils.py index 132704a..721e36f 100644 --- a/phables/workflow/scripts/phables_utils/edge_graph_utils.py +++ b/phables/workflow/scripts/phables_utils/edge_graph_utils.py @@ -7,7 +7,7 @@ from igraph import Graph # Create logger -logger = logging.getLogger("phables 1.3.0") +logger = logging.getLogger("phables 1.3.1") class BidirectionalError(Exception): diff --git a/phables/workflow/scripts/phables_utils/long_utils.py b/phables/workflow/scripts/phables_utils/long_utils.py index a21f43e..f5516c3 100644 --- a/phables/workflow/scripts/phables_utils/long_utils.py +++ b/phables/workflow/scripts/phables_utils/long_utils.py @@ -14,7 +14,7 @@ LEN_THRESHOLD = 0.95 # Create logger -logger = logging.getLogger("phables 1.3.0") +logger = logging.getLogger("phables 1.3.1") def resolve_long( diff --git a/phables/workflow/scripts/phables_utils/output_utils.py b/phables/workflow/scripts/phables_utils/output_utils.py index 582e8a4..16e8bc5 100644 --- a/phables/workflow/scripts/phables_utils/output_utils.py +++ b/phables/workflow/scripts/phables_utils/output_utils.py @@ -5,7 +5,7 @@ FASTA_LINE_LEN = 60 # Create logger -logger = logging.getLogger("phables 1.3.0") +logger = logging.getLogger("phables 1.3.1") def write_unitigs(nodes, unitig_names, graph_unitigs, filename, output): diff --git a/phables/workflow/scripts/phables_utils/short_utils.py b/phables/workflow/scripts/phables_utils/short_utils.py index a268ba0..71b7b6b 100644 --- a/phables/workflow/scripts/phables_utils/short_utils.py +++ b/phables/workflow/scripts/phables_utils/short_utils.py @@ -14,7 +14,7 @@ LEN_THRESHOLD = 0.95 # Create logger -logger = logging.getLogger("phables 1.3.0") +logger = logging.getLogger("phables 1.3.1") def resolve_short(