-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 2
/
run_experiments_gwap.sh
58 lines (39 loc) · 2.41 KB
/
run_experiments_gwap.sh
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
#!/usr/bin/env bash
SNAPSHOTS_DIR=/media/lext/FAST/OARSI_grading_project/workdir/oarsi_grades_snapshots_gwap
DATA_DIR=/media/lext/FAST/OARSI_grading_project/Data/datasets/
META_DIR=/media/lext/FAST/OARSI_grading_project/
SNP_PREF=2019_02
cd scripts
# GWAP
#python train.py --backbone_depth 18 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True
#python train.py --backbone_depth 34 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True
#python train.py --backbone_depth 50 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True
#python train.py --backbone_depth 50 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --se True
#python train.py --backbone_depth 50 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --se True --dw True
# GWAP hidden used
#python train.py --backbone_depth 18 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --use_gwap_hidden True
#python train.py --backbone_depth 34 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --use_gwap_hidden True
#python train.py --backbone_depth 50 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --use_gwap_hidden True
#python train.py --backbone_depth 50 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --se True --use_gwap_hidden True
#python train.py --backbone_depth 50 --weighted_sampling True --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
# --dataset_root ${DATA_DIR} --meta_root ${META_DIR} --use_gwap True --se True --dw True --use_gwap_hidden True
for SNP_NAME in $(ls ${SNAPSHOTS_DIR} | grep ${SNP_PREF});
do
python oof_inference.py --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
--dataset_root ${DATA_DIR} \
--meta_root ${META_DIR}\
--snapshot ${SNP_NAME}
python test.py --snapshots ${SNAPSHOTS_DIR} \
--dataset_root ${DATA_DIR} \
--meta_root ${META_DIR}\
--snapshot ${SNP_NAME}
done