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Problem when install environment on Ubuntu 18.04 by environment.yml #15

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XiaoyuSun-hub opened this issue Dec 3, 2020 · 2 comments
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Problem when install environment on Ubuntu 18.04 by environment.yml #15

XiaoyuSun-hub opened this issue Dec 3, 2020 · 2 comments

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@XiaoyuSun-hub
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Hi， I tried to install conda environment by using the environment.yml you provided on Ubuntu 18.04, I got the following error:
(base) root@deeplearn-light-sunx:/home/sunx/code/Polygonization-by-Frame-Field-Learning# conda env create -f environment.yml
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: done

Downloading and Extracting Packages
ffmpeg-4.1.3 | 75.8 MB | ##################################### | 100%
_libgcc_mutex-0.1 | 3 KB | ##################################### | 100%
pyzmq-19.0.2 | 502 KB | ##################################### | 100%
tifffile-2020.5.7 | 110 KB | ##################################### | 100%
simplejson-3.17.0 | 112 KB | ##################################### | 100%
proj-6.3.0 | 10.3 MB | ##################################### | 100%
jupyterlab_pygments- | 8 KB | ##################################### | 100%
lz4-c-1.8.3 | 187 KB | ##################################### | 100%
click-7.1.1 | 67 KB | ##################################### | 100%
pip-20.0.2 | 1.9 MB | ##################################### | 100%
future-0.18.2 | 716 KB | ##################################### | 100%
jupyter-1.0.0 | 7 KB | ##################################### | 100%
libuuid-2.32.1 | 26 KB | ##################################### | 100%
xorg-libice-1.0.10 | 57 KB | ##################################### | 100%
pickleshare-0.7.5 | 13 KB | ##################################### | 100%
xerces-c-3.2.2 | 1.7 MB | ##################################### | 100%
pexpect-4.8.0 | 84 KB | ##################################### | 100%
setuptools-50.3.0 | 902 KB | ##################################### | 100%
libtiff-4.1.0 | 568 KB | ##################################### | 100%
pandas-1.0.3 | 11.5 MB | ##################################### | 100%
swagger-spec-validat | 21 KB | ##################################### | 100%
qtconsole-4.7.7 | 94 KB | ##################################### | 100%
bzip2-1.0.8 | 105 KB | ##################################### | 100%
monotonic-1.5 | 14 KB | ##################################### | 100%
asn1crypto-1.3.0 | 163 KB | ##################################### | 100%
cairo-1.16.0 | 1.5 MB | ##################################### | 100%
libstdcxx-ng-9.1.0 | 4.0 MB | ##################################### | 100%
click-plugins-1.1.1 | 11 KB | ##################################### | 100%
parso-0.7.0 | 71 KB | ##################################### | 100%
overpy-0.4 | 34 KB | ##################################### | 100%
libgcc-ng-9.1.0 | 8.1 MB | ##################################### | 100%
jedi-0.17.0 | 807 KB | ##################################### | 100%
pyproj-2.5.0 | 417 KB | ##################################### | 100%
xorg-kbproto-1.0.7 | 26 KB | ##################################### | 100%
neptune-client-0.4.1 | 76 KB | ##################################### | 100%
dbus-1.13.14 | 590 KB | ##################################### | 100%
requests-2.23.0 | 91 KB | ##################################### | 100%
json-c-0.13.1 | 70 KB | ##################################### | 100%
google-auth-1.14.1 | 58 KB | ##################################### | 100%
testpath-0.4.4 | 88 KB | ##################################### | 100%
pyrsistent-0.16.0 | 94 KB | ##################################### | 100%
qt-5.12.5 | 99.2 MB | ##################################### | 100%
xmltodict-0.12.0 | 14 KB | ##################################### | 100%
icu-64.2 | 12.6 MB | ##################################### | 100%
nbconvert-6.0.7 | 557 KB | ##################################### | 100%
pytz-2019.3 | 231 KB | ##################################### | 100%
importlib_metadata-1 | 48 KB | ##################################### | 100%
pysocks-1.7.1 | 27 KB | ##################################### | 100%
pyopenssl-19.1.0 | 87 KB | ##################################### | 100%
jupyter_console-6.2. | 26 KB | ##################################### | 100%
libsodium-1.0.18 | 387 KB | ##################################### | 100%
libssh2-1.9.0 | 346 KB | ##################################### | 100%
ipython-7.13.0 | 1.1 MB | ##################################### | 100%
kealib-1.4.13 | 172 KB | ##################################### | 100%
libclang-9.0.1 | 22.3 MB | ##################################### | 100%
imagecodecs-lite-201 | 197 KB | ##################################### | 100%
libnetcdf-4.7.3 | 1.3 MB | ##################################### | 100%
jdcal-1.4.1 | 11 KB | ##################################### | 100%
ncurses-6.2 | 1.1 MB | ##################################### | 100%
openssl-1.1.1h | 3.8 MB | ##################################### | 100%
libxkbcommon-0.10.0 | 475 KB | ##################################### | 100%
idna-2.9 | 56 KB | ##################################### | 100%
cryptography-2.8 | 618 KB | ##################################### | 100%
xorg-xproto-7.0.31 | 72 KB | ##################################### | 100%
x264-1!152.20180806 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
boost-cpp-1.72.0 | 21.8 MB | ##################################### | 100%
notebook-6.1.4 | 6.3 MB | ##################################### | 100%
libopenblas-0.3.7 | 7.6 MB | ##################################### | 100%
yaml-0.1.7 | 73 KB | ##################################### | 100%
plyfile-0.7.2 | 31 KB | ##################################### | 100%
matplotlib-base-3.2. | 7.1 MB | ##################################### | 100%
pandoc-2.11 | 12.5 MB | ##################################### | 100%
ca-certificates-2020 | 128 KB | ##################################### | 100%
joblib-0.14.1 | 202 KB | ##################################### | 100%
oauthlib-3.1.0 | 88 KB | ##################################### | 100%
libkml-1.3.0 | 641 KB | ##################################### | 100%
argon2-cffi-20.1.0 | 49 KB | ##################################### | 100%
jsonschema-3.2.0 | 94 KB | ##################################### | 100%
jupyter_core-4.6.3 | 75 KB | ##################################### | 100%
blinker-1.4 | 21 KB | ##################################### | 100%
cligj-0.5.0 | 12 KB | ##################################### | 100%
prometheus_client-0. | 48 KB | ##################################### | 100%
krb5-1.17.1 | 1.5 MB | ##################################### | 100%
defusedxml-0.6.0 | 23 KB | ##################################### | 100%
fiona-1.8.13 | 1.0 MB | ##################################### | 100%
glib-2.63.1 | 3.4 MB | ##################################### | 100%
liblapack-3.8.0 | 10 KB | ##################################### | 100%
pixman-0.38.0 | 618 KB | ##################################### | 100%
grpcio-1.27.2 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
tbb-2018.0.5 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
xlrd-1.2.0 | 108 KB | ##################################### | 100%
fontconfig-2.13.1 | 340 KB | ##################################### | 100%
zeromq-4.3.3 | 678 KB | ##################################### | 100%
munch-2.5.0 | 16 KB | ##################################### | 100%
snuggs-1.4.7 | 11 KB | ##################################### | 100%
scikit-learn-0.22.1 | 7.3 MB | ##################################### | 100%
nest-asyncio-1.4.1 | 10 KB | ##################################### | 100%
blas-2.14 | 10 KB | ##################################### | 100%
tiledb-1.7.0 | 2.3 MB | ##################################### | 100%
gitdb-4.0.2 | 49 KB | ##################################### | 100%
jinja2-2.11.2 | 97 KB | ##################################### | 100%
freetype-2.9.1 | 822 KB | ##################################### | 100%
readline-8.0 | 428 KB | ##################################### | 100%
pycparser-2.20 | 93 KB | ##################################### | 100%
google-auth-oauthlib | 21 KB | ##################################### | 100%
xz-5.2.5 | 438 KB | ##################################### | 100%
geos-3.8.0 | 1.0 MB | ##################################### | 100%
numpy-base-1.18.1 | 5.3 MB | ##################################### | 100%
sknw-0.13 | 6 KB | ##################################### | 100%
lame-3.100 | 502 KB | ##################################### | 100%
pcre-8.43 | 260 KB | ##################################### | 100%
cffi-1.14.0 | 228 KB | ##################################### | 100%
openjpeg-2.3.1 | 475 KB | ##################################### | 100%
affine-2.3.0 | 19 KB | ##################################### | 100%
zstd-1.4.4 | 982 KB | ##################################### | 100%
skan-0.8 | 28 KB | ##################################### | 100%
networkx-2.4 | 1.2 MB | ##################################### | 100%
certifi-2020.6.20 | 160 KB | ##################################### | 100%
c-ares-1.15.0 | 102 KB | ##################################### | 100%
wcwidth-0.1.9 | 24 KB | ##################################### | 100%
numpy-1.18.1 | 5 KB | ##################################### | 100%
prompt_toolkit-3.0.4 | 11 KB | ##################################### | 100%
freexl-1.0.5 | 44 KB | ##################################### | 100%
pillow-7.1.2 | 658 KB | ##################################### | 100%
urllib3-1.25.8 | 166 KB | ##################################### | 100%
jpeg-9c | 251 KB | ##################################### | 100%
tornado-6.0.4 | 651 KB | ##################################### | 100%
xorg-libxext-1.3.4 | 51 KB | ##################################### | 100%
markdown-3.1.1 | 113 KB | ##################################### | 100%
traitlets-4.3.3 | 135 KB | ##################################### | 100%
xorg-libxrender-0.9. | 31 KB | ##################################### | 100%
cytoolz-0.10.1 | 456 KB | ##################################### | 100%
imutils-0.5.3 | 37 KB | ##################################### | 100%
gst-plugins-base-1.1 | 6.8 MB | ##################################### | 100%
qtpy-1.9.0 | 39 KB | ##################################### | 100%
numba-0.48.0 | 3.4 MB | ##################################### | 100%
bravado-10.5.0 | 30 KB | ##################################### | 100%
cudatoolkit-10.1.243 | 513.2 MB | ##################################### | 100%
libpq-12.2 | 2.8 MB | ##################################### | 100%
zlib-1.2.11 | 120 KB | ##################################### | 100%
python_abi-3.8 | 4 KB | ##################################### | 100%
widgetsnbextension-3 | 1.8 MB | ##################################### | 100%
send2trash-1.5.0 | 16 KB | ##################################### | 100%
py3nvml-0.2.5 | 74 KB | ##################################### | 100%
openh264-1.8.0 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
giflib-5.2.1 | 80 KB | ##################################### | 100%
jsmin-2.2.2 | 21 KB | ##################################### | 100%
ipython_genutils-0.2 | 39 KB | ##################################### | 100%
mkl-2020.0 | 202.1 MB | ##################################### | 100%
gstreamer-1.14.5 | 4.5 MB | ##################################### | 100%
libcurl-7.69.1 | 591 KB | ##################################### | 100%
pytorch-1.4.0 | 433.1 MB | ##################################### | 100%
nss-3.46.1 | 1.9 MB | ##################################### | 100%
harfbuzz-2.4.0 | 1.5 MB | ##################################### | 100%
libopencv-4.2.0 | 55.4 MB | ##################################### | 100%
libxml2-2.9.10 | 1.3 MB | ##################################### | 100%
websocket-client-0.5 | 63 KB | ##################################### | 100%
libgdal-3.0.4 | 18.9 MB | ##################################### | 100%
cfitsio-3.470 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
nose-1.3.7 | 211 KB | ##################################### | 100%
zipp-3.1.0 | 13 KB | ##################################### | 100%
xorg-libsm-1.2.3 | 25 KB | ##################################### | 100%
nbclient-0.5.1 | 60 KB | ##################################### | 100%
opencv-4.2.0 | 19 KB | ##################################### | 100%
xorg-xextproto-7.3.0 | 27 KB | ##################################### | 100%
geojson-2.5.0 | 15 KB | ##################################### | 100%
pywavelets-1.1.1 | 4.4 MB | ##################################### | 100%
rasterio-1.1.3 | 8.4 MB | ##################################### | 100%
sqlite-3.31.1 | 2.0 MB | ##################################### | 100%
curl-7.69.1 | 148 KB | ##################################### | 100%
xorg-libx11-1.6.9 | 918 KB | ##################################### | 100%
scipy-1.4.1 | 19.1 MB | ##################################### | 100%
scikit-image-0.16.2 | 25.2 MB | ##################################### | 100%
libgfortran-ng-7.3.0 | 1.3 MB | ##################################### | 100%
poppler-data-0.4.9 | 3.5 MB | ##################################### | 100%
gitpython-3.1.1 | 341 KB | ##################################### | 100%
matplotlib-3.2.1 | 20 KB | ##################################### | 100%
libllvm9-9.0.1 | 25.1 MB | ##################################### | 100%
gnutls-3.6.5 | 1.9 MB | ##################################### | 100%
pyqt-5.12.3 | 6.3 MB | ##################################### | 100%
prompt-toolkit-3.0.4 | 240 KB | ##################################### | 100%
hdf4-4.2.13 | 714 KB | ##################################### | 100%
tk-8.6.10 | 3.2 MB | ##################################### | 100%
entrypoints-0.3 | 10 KB | ##################################### | 100%
et_xmlfile-1.0.1 | 21 KB | ##################################### | 100%
jsonref-0.2 | 11 KB | ##################################### | 100%
mistune-0.8.4 | 54 KB | ##################################### | 100%
smmap-3.0.2 | 24 KB | ##################################### | 100%
pyasn1-modules-0.2.7 | 63 KB | ##################################### | 100%
python-dateutil-2.8. | 224 KB | ##################################### | 100%
libxcb-1.13 | 502 KB | ##################################### | 100%
torchvision-0.5.0 | 9.1 MB | ##################################### | 100%
nspr-4.22 | 1.6 MB | ##################################### | 100%
python-3.8.2 | 57.8 MB | ##################################### | 100%
jupyter_client-6.1.7 | 76 KB | ##################################### | 100%
msgpack-python-1.0.0 | 98 KB | ##################################### | 100%
jasper-1.900.1 | 198 KB | ##################################### | 100%
shapely-1.7.1 | 443 KB | ##################################### | 100%
backcall-0.1.0 | 20 KB | ##################################### | 100%
libcblas-3.8.0 | 10 KB | ##################################### | 100%
libwebp-1.0.2 | 938 KB | ##################################### | 100%
dask-core-2.15.0 | 609 KB | ##################################### | 100%
cachetools-3.1.1 | 14 KB | ##################################### | 100%
libspatialite-4.3.0a | 3.1 MB | ##################################### | 100%
markupsafe-1.1.1 | 34 KB | ##################################### | 100%
libffi-3.2.1 | 40 KB | ##################################### | 100%
ninja-1.9.0 | 1.6 MB | ##################################### | 100%
rsa-4.0 | 30 KB | ##################################### | 100%
absl-py-0.9.0 | 166 KB | ##################################### | 100%
pyjwt-1.7.1 | 32 KB | ##################################### | 100%
six-1.14.0 | 27 KB | ##################################### | 100%
terminado-0.9.1 | 26 KB | ##################################### | 100%
chardet-3.0.4 | 170 KB | ##################################### | 100%
intel-openmp-2020.0 | 916 KB | ##################################### | 100%
nbformat-5.0.8 | 101 KB | ##################################### | 100%
packaging-20.4 | 35 KB | ##################################### | 100%
toolz-0.10.0 | 50 KB | ##################################### | 100%
werkzeug-1.0.1 | 243 KB | ##################################### | 100%
openpyxl-3.0.3 | 158 KB | ##################################### | 100%
liblapacke-3.8.0 | 10 KB | ##################################### | 100%
llvmlite-0.31.0 | 17.7 MB | ##################################### | 100%
pyasn1-0.4.8 | 58 KB | ##################################### | 100%
pandocfilters-1.4.2 | 13 KB | ##################################### | 100%
hdf5-1.10.5 | 3.1 MB | ##################################### | 100%
ptyprocess-0.6.0 | 23 KB | ##################################### | 100%
xorg-renderproto-0.1 | 8 KB | ##################################### | 100%
ld_impl_linux-64-2.3 | 645 KB | ##################################### | 100%
libpng-1.6.37 | 364 KB | ##################################### | 100%
geotiff-1.5.1 | 279 KB | ##################################### | 100%
ipywidgets-7.5.1 | 102 KB | ##################################### | 100%
pyparsing-2.4.7 | 64 KB | ##################################### | 100%
pyyaml-5.3.1 | 195 KB | ##################################### | 100%
decorator-4.4.2 | 14 KB | ##################################### | 100%
cycler-0.10.0 | 14 KB | ##################################### | 100%
webencodings-0.5.1 | 20 KB | ##################################### | 100%
libiconv-1.15 | 2.0 MB | ##################################### | 100%
ipykernel-5.3.4 | 177 KB | ##################################### | 100%
cloudpickle-1.4.0 | 29 KB | ##################################### | 100%
postgresql-12.2 | 4.4 MB | ##################################### | 100%
libdap4-3.20.4 | 18.5 MB | ##################################### | 100%
gdal-3.0.4 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
requests-oauthlib-1. | 22 KB | ##################################### | 100%
protobuf-3.11.4 | 714 KB | ##################################### | 100%
multiprocess-0.70.9 | 205 KB | ##################################### | 100%
async_generator-1.10 | 23 KB | ##################################### | 100%
tqdm-4.43.0 | 56 KB | ##################################### | 100%
bravado-core-5.16.0 | 46 KB | ##################################### | 100%
bleach-3.2.1 | 111 KB | ##################################### | 100%
libblas-3.8.0 | 10 KB | ##################################### | 100%
libprotobuf-3.11.4 | 4.8 MB | ##################################### | 100%
dill-0.3.1.1 | 120 KB | ##################################### | 100%
poppler-0.67.0 | 8.9 MB | ##################################### | 100%
pygments-2.6.1 | 687 KB | ##################################### | 100%
imageio-2.8.0 | 3.1 MB | ##################################### | 100%
olefile-0.46 | 33 KB | ##################################### | 100%
tensorboard-2.1.0 | 3.4 MB | ##################################### | 100%
attrs-19.3.0 | 39 KB | ##################################### | 100%
kiwisolver-1.2.0 | 91 KB | ##################################### | 100%
libedit-3.1.20181209 | 188 KB | ##################################### | 100%
graphite2-1.3.13 | 101 KB | ##################################### | 100%
wheel-0.34.2 | 49 KB | ##################################### | 100%
py-opencv-4.2.0 | 21 KB | ##################################### | 100%
expat-2.2.9 | 191 KB | ##################################### | 100%
nettle-3.4.1 | 6.7 MB | ##################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
Installing pip dependencies: / Ran pip subprocess with arguments:
['/root/anaconda3/envs/frame_field/bin/python', '-m', 'pip', 'install', '-U', '- r', '/home/sunx/code/Polygonization-by-Frame-Field-Learning/condaenv.bjguh6zr.re quirements.txt']
Pip subprocess output:
Collecting calmsize==0.1.3
Downloading calmsize-0.1.3.tar.gz (3.7 kB)
Collecting coverage==5.1
Downloading coverage-5.1-cp38-cp38-manylinux1_x86_64.whl (229 kB)
Collecting cython==0.29.17
Downloading Cython-0.29.17-cp38-cp38-manylinux1_x86_64.whl (2.0 MB)
Collecting descartes==1.0.1
Downloading descartes-1.0.1.tar.gz (3.3 kB)
Collecting gym==0.17.1
Downloading gym-0.17.1.tar.gz (1.6 MB)
Collecting imagecodecs==2020.2.18
Downloading imagecodecs-2020.2.18-cp38-cp38-manylinux2014_x86_64.whl (19.2 MB)

Pip subprocess error:
ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement kornia==0.1.2+7bc b521 (from -r /home/sunx/code/Polygonization-by-Frame-Field-Learning/condaenv.bj guh6zr.requirements.txt (line 7)) (from versions: 0.1.3.post2, 0.1.4, 0.1.4.post 2, 0.2.0, 0.2.1, 0.2.2, 0.3.0, 0.3.1, 0.3.2, 0.4.0, 0.4.1)
ERROR: No matching distribution found for kornia==0.1.2+7bcb521 (from -r /home/s unx/code/Polygonization-by-Frame-Field-Learning/condaenv.bjguh6zr.requirements.t xt (line 7))
fa iled

CondaEnvException: Pip failed

What else I can do to solve it.
@zhenghan408
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i face the same error ,did you solve it?thanks ~

@aymanaboghonim
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you can install kornia from this command ((pip install "git+https://github.com/waleedka/coco.git#egg=pycocotools&subdirectory=PythonAPI"))

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