vasp-4.6-ompi-iqtc02.sub

#!/bin/bash 
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# SGE options and parameters
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# (1) Name of the job 
#$ -N VASP-4.6-OMPI
# (2) Requested resources 
# Parallel Environment and number of cores
#$ -pe ompi 16
# Queue
#$ -q iqtc02.q
# Shell
#$ -S /bin/bash
# (3) Output files 
#$ -cwd 
#$ -o vasp-ompi.out 
#$ -e vasp-ompi.err 
# (4) Remove the first '#' of the following 2 lines if you want to receive an email when the job ends.
##$ -m e 
##$ -M  yourmail@ub.edu
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# User environment. 
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# Load the modules needed 
. /etc/profile.d/modules.sh
module load vasp/4.6
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# Copying files needed 
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# We copy the inputs to the directory where the jobs will run 
echo "Got $NSLOTS processors."
cd $WORKDIR 
cp -r $HOME/TESTS/vasp-4.6/tests/test-hg/* .
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# Run the job 
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startdir=$PWD
export OMP_NUM_THREADS=1
export MPICH_PROCESS_GROUP=no
mpirun -np $NSLOTS /aplic/VASP/4.6_intel_11.0.074_openmpi/vasp.4.6/vasp

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# Copy the results to our home directory
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mkdir -p $HOME/TESTS/vasp-4.6/tests/out
cp -r * $HOME/TESTS/vasp-4.6/tests/out/