stress_x86-64.sub

#!/bin/bash 
##########################################
# SGE options and parameters
########################################## 
# (1) Name of the job 
#$ -N STRESS-ncores 
# (2) Requested resources 
# Parallel Environment and number of cores
#$ -pe smp ncores
# Shell
#$ -S /bin/bash
# (3) Output files 
#$ -cwd 
#$ -o $HOME/stress-out/stress-$HOSTNAME.out
#$ -e $HOME/stress-out/stress-$HOSTNAME.err
# (4) Remove the first '#' of the following 2 lines if you want to receive an email when the job ends.
##$ -m e 
##$ -M yourmail@ub.edu 
##########################################
# User environment. 
########################################## 
# Load the modules needed 
. /etc/profile.d/modules.sh
module load stress/1.0.4
########################################## 
# Copying files needed 
########################################## 
# We copy the inputs to the directory where the jobs will run 
cd $TMPDIR
########################################## 
# Run the job 
disk=$(df -hP /scratch | tail -1 | gawk '{DF=$2; if( DF ~ /G/){gsub("G","",DF); print DF/100}}')
mem=$(cat /proc/meminfo | grep MemFree | gawk '{print $2/1024/20}')
stress_x86-64 --cpu $NSLOTS -m 20 --vm-bytes $mem -d 100 --hdd-bytes $disk
########################################## 
# redirecciono un dmesg per revisar possibles errors de sistema
dmesg > $HOME/stress-out/dmesg-$HOSTNAME.out