molcas.sub

#!/bin/bash 
# Script per enviar càlculs de Molcas
# amb 4 processadors sobre la mateixa maquina
#                - Jordi Blasco 12/08/07 -
##########################################
# Opcions i parametres de l'SGE
########################################## 
# (1) Nom del treball (per identificar) 
#$ -N Molcas-prova01
# (2) Recursos sol.licitats 
#$ -l h_rt=0:50:0 
#$ -l mem_free=4.0G 
#$ -pe smp 4
# (3) Fitxers de sortida 
#$ -cwd 
#$ -o molcas01.out 
#$ -e molcas01.err 
# (4) Envia un mail quan acava el treball.
#$ -m e 
#$ -M jblasco@fbg.ub.es 
##########################################
# Entorn d.usuari 
########################################## 
# Es carreguen els moduls a utilitzar 
module load molcas
########################################## 
# transferencia de dades 
########################################## 
# Es copien les dades al directori on es llenc,aran els calculs. 
cd $TMPDIR
export Project=Jobname
export Input="$Project".input
export Output="$Project".out 
cp -pr $HOME/path/amb/el/input/fitxer.input $Input
########################################## 
# calcul 
########################################## 
# Es crea un directori de sortida pels resultats.
export OMP_NUM_THREADS=$NSLOTS
export CPUS=4
molcas "$Input" >>"$Output"

########################################## 
# Transferencia dels resultats
########################################## 
cp -pr $Output $HOME/path/a/on/guardar/output/