gaussian-09-linda-iqtc04.sub

#!/bin/csh
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# SGE options and parameters
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# (1) Name of the job
#$ -N test_gaus
# (2) Requested resources
# Parallel Environment and number of cores
#$ -pe linda 24 
# Queue
#$ -q iqtc04.q
# Shell
#$ -S /bin/csh
# (3) Output files
#$ -cwd
#$ -o testl_gaus.out
#$ -e testl_gaus.err
# (4) Remove the first '#' of the following 2 lines if you want to receive an email when the job ends.
##$ -m e 
##$ -M  yourmail@ub.edu
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# User environment.
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# Load the modules needed
. /etc/profile.d/modules.csh
module load gaussian/g09b01
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# Copying files needed
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# We copy the inputs to the directory where the jobs will run
cd $TMPDIR
cp -r $HOME/proves/h2o_opt.dat . 

# Es carreguen algunes variables pel Linda

setenv GAUSS_SCRDIR $TMPDIR
setenv NODES \"`cat $TMPDIR/tsnet.nodes | uniq`\"
setenv GAUSS_LFLAGS "-v -nodelist ${NODES} -mp 12"

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# Run the job
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# We run gaussian g09
g09 < ./h2o_opt.dat > h2ol_opt.log
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# Copy the results to our home directory
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mkdir $HOME/proves/resultatl
cp -r . $HOME/proves/resultatl/