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import glob
import os
import pandas as pd
import numpy as np
from pyspark.sql import SparkSession
import pyspark.sql.functions as F
from pyspark.sql.types import StructType, StructField, StringType, FloatType, IntegerType, TimestampType
# creación entorno de trabajo
spark = SparkSession.builder\
.appName("limpieza_y_validacion_de_datos")\
.config('spark.driver.memory', '12g')\
.getOrCreate()
path_actual = os.getcwd()
parquetList = glob.glob(path_actual + "/" + "DATA" + "/*/*.parquet") # lista de parquets
# lectura de archivos en pyspark
def readParquet(parquetDF):
"""
Lectura de archivos parquet. Retorna un dataframe pyspark
"""
df_parquet = spark.read.parquet(parquetDF) # reemplazar por el ingreso del DF
df_parquet = df_parquet.drop("DeviceId", "Sistema", "Timestamp", "TimestampUTC", "IdVerificacion")
df_parquet = df_parquet.withColumnRenamed('DispositivoId', 'dispositivoId')\
.withColumnRenamed('Nombre', 'parametro')\
.withColumnRenamed('Valor', 'valor')\
.withColumnRenamed('Unidad', 'unidad')\
.withColumnRenamed('EstampaTiempo', 'fecha')
# df_pandas = df_parquet.toPandas()
return df_parquet
def typeDF(parquetDF, typeData):
df = None
if typeData == "Crudo":
# IMPORTANTE CORREGIR VALORES EN DB
df = parquetDF.filter(F.col("Crudo") == "DC ").drop("Calibraciones", "Validados")
elif typeData == "Calibraciones":
df = parquetDF.filter(F.col("Calibraciones") == "DP").drop("Crudo", "Validados")
elif typeData == "Validados":
df = parquetDF.filter(F.col("Validados") == "DV").drop("Crudo", "Calibraciones")
else:
print("typeData invalido")
df_pandas = df.toPandas()
return df_pandas
def typeDF_parquet(parquetDF, typeData):
"""
Filtra por tipo de dato (crudo, calibrado, validado). Retorna un dataframe en pyspark
"""
df = None
if typeData == "Crudo":
# IMPORTANTE CORREGIR VALORES EN DB
df = parquetDF.filter(F.col("Crudo") == "DC ").drop("Calibraciones", "Validados")
elif typeData == "Calibraciones":
df = parquetDF.filter(F.col("Calibraciones") == "DP").drop("Crudo", "Validados")
elif typeData == "Validados":
df = parquetDF.filter(F.col("Validados") == "DV").drop("Crudo", "Calibraciones")
else:
print("typeData invalido")
return df
def exploreValues(df, colList, attr=None):
res, result = {}, None
if attr is None:
for column in colList:
if column in ["valor", "fecha"]: pass
else:
res[column] = df[column].unique()
result = res
else:
try:
result = df[column].unique()
except:
res[attr] = str(attr) + " doesn't exists"
result = res
return result
def exploreValues_parquet(df, colList, attr=None):
res, result = {}, None
if attr is None:
for column in colList:
if column in ["valor", "fecha"]: pass
else:
tmpList = df.select(column).distinct()
distinctValList = [row[column] for row in tmpList.collect()]
res[column] = distinctValList
result = res
else:
try:
tmpList = df.select(attr).distinct()
distinctValList = [row[attr] for row in tmpList.collect()]
result = distinctValList
except:
res[attr] = str(attr) + "doesn't exists"
result = res
return result
def cleanDF(df):
df = df.dropna()
df = df.drop_duplicates()
for cols in ['Crudo', 'Calibraciones', 'Validados']:
if cols not in df.columns:
df[cols] = np.nan
return df
def cleanDF_parquet(parquetDF):
parquetDF = parquetDF.na.drop()
parquetDF = parquetDF.dropDuplicates()
for cols in ['Crudo', 'Calibraciones', 'Validados']:
if cols not in parquetDF.columns:
parquetDF = parquetDF.withColumn(cols, F.lit(None).cast(FloatType()))
# print("parquetDF.count()", parquetDF.count())
return parquetDF
def cleanDFv2_parquet(parquetDF):
schema = StructType([
StructField("UfId", IntegerType(), True),
StructField("ProcesoId", IntegerType(), True),
StructField("dispositivoId", IntegerType(), True),
StructField("parametro", StringType(), True),
StructField("valor", FloatType(), True),
StructField("unidad", StringType(), True),
StructField("fecha", TimestampType(), True),
StructField("Crudo", StringType(), True),
StructField("Calibraciones", StringType(), True),
StructField("Validados", StringType(), True)
])
finalDF = spark.createDataFrame([], schema)
listProcId = exploreValues_parquet(parquetDF, parquetDF.columns, attr='ProcesoId')
for procId in listProcId:
# print(procId)
dfProcId = parquetDF.filter(F.col("ProcesoId") == procId)
listParams = exploreValues_parquet(dfProcId, dfProcId.columns, attr='parametro')
# print(listParams)
for param in listParams:
dfParam = dfProcId.filter(F.col("parametro") == param)
listDispId = exploreValues_parquet(dfParam, dfParam.columns, attr='dispositivoId')
# print(procId, param, listDispId)
if len(listDispId) == 1:
dfParam = dfParam.na.drop()
dfParam = dfParam.dropDuplicates()
for cols in ['Crudo', 'Calibraciones', 'Validados']:
if cols not in dfParam.columns:
dfParam = dfParam.withColumn(cols, F.lit(None).cast(FloatType()))
dfParam = dfParam.select("UfId", "ProcesoId", "dispositivoId", "parametro", "valor", "unidad", "fecha", "Crudo", "Calibraciones", "Validados")
finalDF = finalDF.union(dfParam)
# else:
# AIUDA
# No sé si las mediciones de dos o más dispositivos son al mismo tiempo, por lo que no estoy segura de cómo promediar
# print("finalDF.count()", finalDF.count())
return finalDF
def returnDF(df, typeData):
tmpDF = readParquet(parquet) # reemplazar por el ingreso del DF
typeFilter = typeDF(tmpDF, typeData)
cleanedDF = cleanDF(typeFilter)
return cleanedDF
def returnDF_parquet(parquet, typeData):
tmpDF = readParquet(parquet) # reemplazar por el ingreso del DF
typeFilter = typeDF_parquet(tmpDF, typeData)
cleanedDF = cleanDF_parquet(typeFilter)
return cleanedDF
# for parquet in parquetList:
# print(returnDF_parquet(parquet, "Validados").show())
"""
Si se requiere, escribir función para concatenar otra vez los dataframes
"""
# Devuelve el dataframe "crudo" de pandas para los datos validados
returnDF(parquetList[0], "Validados")
# Devuelve el dataframe "crudo" de pyspark para los datos validados
returnDF_parquet(parquetList[0], "Validados")
spark.stop()