-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 18
/
ODM_parts_2.2.3.csv
We can't make this file beautiful and searchable because it's too large.
1541 lines (1539 loc) · 811 KB
/
ODM_parts_2.2.3.csv
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
partID,partLabel,partType,partDesc,partInstr,domain,specimenSet,compartmentSet,group,class,nomenclature,ontologyRef,latExp,mmaSet,unitSet,aggregationScale,aggregationSet,qualityIndSet,missingnessSet,status,firstReleased,lastUpdated,changes,protocolSteps,protocolStepsRequired,protocolStepsOrder,protocolRelationships,protocolRelationshipsRequired,protocolRelationshipsOrder,measures,measuresRequired,measuresOrder,measureSets,measureSetsRequired,measureSetsOrder,datasets,datasetsRequired,datasetsOrder,sites,sitesRequired,sitesOrder,samples,samplesRequired,samplesOrder,addresses,addressesRequired,addressesOrder,contacts,contactsRequired,contactsOrder,organizations,organizationsRequired,organizationsOrder,instruments,instrumentsRequired,instrumentsOrder,polygons,polygonsRequired,polygonsOrder,languages,languagesRequired,languagesOrder,translations,translationsRequired,translationsOrder,parts,partsRequired,partsOrder,sets,setsRequired,setsOrder,qualityReports,qualityReportsRequired,qualityReportsOrder,sampleRelationships,sampleRelationshipsRequired,sampleRelationshipsOrder,protocols,protocolsRequired,protocolsOrder,countries,countriesRequired,countriesOrder,zones,zonesRequired,zonesOrder,wideNames,wideNamesRequired,wideNamesOrder,refLink,dataType,minValue,maxValue,minLength,maxLength
a1306s,a1306s delta-variant gene target,measurements,a1306s delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
a1918v,a1918v delta-variant gene target,measurements,a1918v delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
a2710t,a2710t omicron-variant gene target,measurements,a2710t omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
a63t,a63t omicron-variant gene target,measurements,a63t omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
a67v,a67v omicron-variant gene target,measurements,a67v omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
a67vDel69Del70,Omicron Variant a67v del69 and del70 mutations,measurements,"Omicron Variant a67v mutation, and del 69 and del70 mutations co-occuring",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
aas,Atline Analyzer,categories,Atline analyzer with sampler.,An atline analyzer with sampler.,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
absHum,Absolute humidity,measurements,A measure of the total mass of water vapour present in the air per volume of air.,NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,humid,naNomenclature,NA,NA,NA,absHumidUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
absHumidUnitSet,Absolute humidity unit set,unitSets,Unit set for absolute humidity measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,absHumidUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
academ,Academic institution,categories,The category of organization type used for academic institutions or research groups.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
acinetobacter,Acinetobacter,measurements,Acinetobacter,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,acinetobacterGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
acinetobacterGrp,Acinetobacter Group,groups,A group of measures/methods related to acinebacter bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,acinetobacterGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
acti,Number of active cases,units,Number of active cases.,NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
actiEp,Number of active cases by episode date,units,Number of active cases by episode date.,"Episode date is the earliest of onset, test or reported date for a confirmed case.",bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
actiOn,Number of active cases by Onset date,units,Number of active cases by onset date.,"Episode date is the earliest of onset, test or reported date for a confirmed case.",bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
actiRep,Number of active cases by Report date,units,Number of active cases by report date.,"Episode date is the earliest of onset, test or reported date for a confirmed case.",bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
actiTest,Number of active cases by test date,units,Number of active cases by test date.,"Episode date is the earliest of onset, test or reported date for a confirmed case.",bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
active,Active,categories,Indicator that a part is in current use.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ad,Address table Shorthand,shortName,"The abbreviated short name used to reference the The table that contains information about addresses. Addresses can recorded for sites, organizations or contacts (indivduals). ",table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
aDate,Analysis date,attributes,Date the measurement was performed in the lab.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.1.0,Github Issue #211,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
aDateEnd,Analysis date end,attributes,Date the measurement or analysis was completed.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,Depreciated. See issue #211. https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues/211,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
aDateStart,Analysis date start,attributes,Date the measurement or analysis was started.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
addL1,Address Line 1,attributes,"Line 1 (the street name, number and direction) for a given address.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
addL2,Address Line 2,attributes,Line 2 (the unit number) for a given address.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
addresses,Address table,tables,"The table that contains information about addresses. Addresses can recorded for sites, organizations or contacts (indivduals). ","The Sites, Organizations, and Contacts tables include a link to the addresses table through Address ID.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,programDescr,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,46,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
addressesOrder,Addresses table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in the Addresses table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,48,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
addressesRequired,Address table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Addresses table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,47,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
addressID,Address ID,attributes,A unique identifier for an address.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,7,NA,NA,NA,pK,mandatory,1,NA,NA,NA,fK,mandatory,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
adenovirusF40,Adenovirus (F40/41),measurements,Adenovirus (F40/41),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,adenovirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
adenovirusGrp,Adenovirus Group,groups,A group of measures/methods related to Adenoviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,adenovirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
admRegLevel,Administrative regions,attributes,Administrative regions,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,depreciated,2.0.0,2.1.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
adv40,Adenovirus 40,measurements,Adenovirus serotype 40.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,adenovirusGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
adv41,Adenovirus 41,measurements,Adenovirus serotype 41.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,adenovirusGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
advF41Fibre,Adenovirus F41 Fibre Gene Target,measurements,Human Adenovirus Group F41 Fiber gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,adenovirusGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
afl30,Academic Free License v3.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Academic Free License v3.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/afl-3.0/,varchar,NA,NA,0,30
afu,Air filter,categories,Air filter as part of filtration or circulating unit. ,Typically the unit would have a fan or blower. ,naDomain,saSpecimenSet,airCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
aggragationScale,Aggregation scale,attributes,A scale used for an aggregation. Only applicable for measures and units.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,17,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
aggregation,Aggregation,attributes,Statistical measures used to report a measure. Each aggregation has a corresponding value.,"The default aggregation is `single`, which corresponds to a single measurement. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,restructured,fK,mandatoryIf,13,NA,NA,NA,fK,mandatory,20,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
aggregationInput,Aggregation input (wide table),attributes,The partID for the aggregation being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,27,NA,varchar,NA,NA,0,30
aggregationName,Aggregation name (wide table),attributes,The aggregation referenced for the wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,26,NA,varchar,NA,NA,0,30
aggregations,Aggregations,partType,Statistical measures used to report a measure. Each measure reported as a number should be reported with an aggregation.,"The default aggregation is `single`, which corresponds to a single measurement. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
aggregationScales,Aggregation scales,partType,The scale of an aggregation set. Aggregation scales include quantitative and qualitative.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
aggregationSet,Aggregation set,attributes,The aggregation set for a unit.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,18,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
aggregationSets,Aggregation sets,partType,Sets of aggregations.,"Examples of aggregation sets include logarithm, linear and boolean.",naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
agpl30,GNU Affero General Public License v3.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the GNU Affero General Public License v3.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/agpl-3.0/,varchar,NA,NA,0,30
air,Air compartment,compartments,A measure or observation made from a substance in the air.,NA,allDo,anySpecimenSet,airCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0, changed to partType = compartment",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,1
airCompartmentSet,Air compartment set,compartmentSets,A compartment set for measures and methods in the air compartment.,NA,allDo,anySpecimenSet,airCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
airpln,Airplane,categories,Airplane sample shed category type,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
airport,Airport,categories,Airport sample shed category type,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
airportLists,Airport lists worksheet,dictionarySupport,Parts lists used to generate airport and airplane data entry templates.,NA,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,NA,NA
airportSheetSet,Airport Sheets Set,dictSets,Worksheets in the full airport surveillance template (list + template).,`ODM_template-planes_{version}.xlxs,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
airportTemplate,Airport Surveillance Template,dictionarySupport,The input template for airport and airplane surveillance in the EU.,NA,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.1.0,Update,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,NA,NA
airSurfaceCompartmentSet,Air and surface compartment set,compartmentSets,A compartment set for measures and methods in the air or surface compartments.,NA,allDo,anySpecimenSet,airSurfaceCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
airTemp,Environmental temperature,measurements,Environmental temperature.,NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,temperature,naNomenclature,NA,NA,NA,temperatureUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
airWaterCompartmentSet,Air and water compartment set,compartmentSets,A compartment set for measures and methods in the air or water compartments.,NA,allDo,anySpecimenSet,airWaterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
aliasDep,Alias depreciated,attributes,ID of an assay that is the same or similar. A comma separated list.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Use notes instead.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
aliasIDDep,Alias ID depreciated,attributes,Alias id,ID of an assay that is the same or similar. a comma separated list.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
allDo,All domains,domains,"Domain that specifies that it could apply to al domains; biological, chemical, and physical.",NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
allele,Alleles class,classes,Measures and methods related to alleles.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,measQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
alleleUnitSet,Allele unit set,unitSets,Unit set for alleles.,NA,naDomain,siSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,alleleUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
allOrgs,Access to all org,attributes,"If this is 'no', this data will not be available to any partner organization. If missing, data will be available to the all organizations.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,1
alod,Assay Limit of Detection (LOD),measurements,"The minimum level of a target consistently detectable (e.g., with 95% probability) using the assay considering only the amplification and quantification steps of RT-qPCR.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
aloh3,Aloh3 precipitation,categories,Aloh3 precipitation,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
amDefDep,Assay method id default depreciated,attributes,Used as default when a new measurement is created for this lab. See ID in AssayMethod table.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Specify in type, or contact the PHES-ODM research team to add your specific item via a github issue (https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues), or at [email protected]",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
amiconUf,Amicon ultrafiltration,categories,Amicon ultrafiltration,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
amiMP96,"Amicon filter, extract with MP96",categories,"Nucleaic acid extraction, usually used for the liquid fraction of a wastewater sample, using amicon filtration and using an MP96 for final extraction.",NA,bio,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
amp,Amplicon sequencing,categories,Specifies the amplicon strategy for genetic sequencing,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
amrGrp,Anti-microbial resistance Group,groups,The group for measures and methods pertaining to anti-microbial resistant microbes (general).,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,amrGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,50
anaplasmaGrp,Anaplasma Group,groups,A group of measures/methods related to anaplasma bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,anaplasmaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
andBoo,AND Boolean aggregation,aggregations,"""AND"" aggreation.","If all values in the aggregation is ""TRUE"" then the AND aggregation is also ""TRUE"". If all values in the aggregation is ""FALSE"" then the AND aggregation is also ""TRUE"". ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
anneal,annealing/extension,categories,Describes the annealing and/or extension cycle in a PCR process.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
anyCompartmentSet,Any compartment set,compartmentSets,A compartment set for measures and methods in any compartment.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
anySpecimenSet,Any specimen set,specimenSets,A specimen set that inculdes any specimen.,NA,naDomain,anySpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
apache20,Apache license 2.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Apache license 2.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/apache-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
aPhagocytophilum,Anaplasma phagocytophilum,measurements,Anaplasma phagocytophilum,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,anaplasmaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
areaPr,Area proportional sample,categories,An area proportional sample.,Used for surface testing.,naDomain,naSpecimenSet,surfaceCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
arTemp,Arrival temperature,measurements,The temperature of a sample upon arrival at the laboratory for analysis.,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,miscMeas,temperature,naNomenclature,NA,NA,NA,temperatureUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
articV3,Use of the articV3 primer,categories,Initial implementation of an ARTIC bioinformatics platform for nanopore sequencing of nCoV2019 novel coronavirus; Artic Foundation v3 primer.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
articV4,Use of the articV4 primer,categories,Artic V4 sequencing primer for VOCs and VOIs.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
artistic20,Artistic license 2.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Artistic license 2.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/artistic-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
asID,Assay ID,attributes,Links with the AssayMethod used to perform the analysis. Use instrument.ID for measures that are not viral measures.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Refer to methodID instead.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, now covered by partID = methodID",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
astrovirus,Astrovirus,measurements,Astrovirus,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,astrovirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
astrovirusGrp,Astrovirus Group,groups,A group of measures/methods related to astroviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,astrovirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
attributeInput,Attribute input (wide table),attributes,The partID for the attribute being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,30,NA,varchar,NA,NA,0,30
attributeName,Attribute name (wide table),attributes,The attribute referenced for the wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,29,NA,varchar,NA,NA,0,30
attributes,Attributes,partType,"Attributes describe the who, where, when, and why of environmental surveillance. ","There are attributes for domain, specimen, compartment, or table. Attributes are one of the three main components or ways to report environment surviellence data. The other two components are measures and methods.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
mpxB6R,Mpox B6R Gene Target,measurements,Human MPox Virus (hMPXV) gene target. Envelope protien gene CDC Assay; selective for MPXV.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi.org/10.1016/j.jcv.2006.03.012,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
babesia,Babesia,measurements,Babesia,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,babesiaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
babesiaGrp,Babesia or Nuttallia Group,groups,A group of measures/methods related to babesia parasites.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,babesiaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bact16sABIFor,Bacteroides 16S forward primer (HF183) (ABI),categories,Bacteroides 16S forward primer (HF183) (ABI),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bacteroidesGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bact16sABIProbe,Bacteroides 16S probe (BacP234) (ABI),categories,Bacteroides 16S probe (BacP234) (ABI),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bacteroidesGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bact16sABIRev,Bacteroides 16S reverse primer (BacR287) (ABI),categories,Bacteroides 16S reverse primer (BacR287) (ABI),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bacteroidesGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bacteria,Bacteria Class,classes,Measures and methods relating to bacteria.,NA,bio,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,bacteria,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bacteriaUnitSet,Bacteria unit set,unitSets,Unit set for bacteria-related measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
bacteroidesGrp,Bacteroides Group,groups,A group of measures/methods related to bacteroides bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bacteroidesGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bactMisc,Miscellaneous bacteria group,groups,A group of measures/methods related to miscellaneous bacteria.,"The miscallenous bacteria are often have only one measure or method. When a bacteria has many measures, they will be given their own groupID in updated dictionary versions.",bio,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,bactMisc,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,depreciated,2.0.0,2.2.0,Depreciated in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bbMP96,"Bead beating, extract with MP96",categories,"Nucleaic acid extraction, usually used for solid fraction of a wastewater sample, using bead beating and using an MP96 for final extraction.",NA,bio,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
bBurgdorferi,Borrelia burgdorferi,measurements,Borrelia burgdorferi,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,borreliaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
bcov,bcov,measurements,Measure of the amount of bovine coronavirus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,betaCoronaGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
bcovCul,bcov culture spike target,categories,Cultured bovine coronavirus is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bcovGen,bcov spike target (unspecified),categories,The bovine coronavirus (unspecified) is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bcovVac,bcov vaccine spike target,categories,The bovine coronavirus vaccine is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
beeExtractFloc,Beef extract flocculation,categories,Beef extract flocculation.,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
before,Is Before ,categories,Specifies that the object step or protocol occurs before the subject step or protocol in the overall protocol container.,Use only for protocolRelationships table relationshipID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
beLOD,Below LOD,qualityIndicators,Measure is below the limit of detection (LOD) for a specific analyte.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
beta,Beta,measurements,B.1.351,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
betaCoronaGrp,Beta Coronavirus Group,groups,A group of measures/methods related to beta coronaviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,betaCoronaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bio,Biologic,domains,A living organism or biological substance.,NA,bio,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bioRadDdpcr,Digital droplet emulsification PCR,categories,Describes a PCR analysis done using BioRad's digital droplet emulsification PCR technology.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bLacAMRGrp,Beta-Lactamase Anti-microbial resistance Group,groups,The group for measures and methods pertaining to beta-lactamase-related anti-microbial resistance.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,50
blaCMY,Cephamycin Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,Cephamycin Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaCTXM1,CTX-M Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,CTX-M Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaIMP,Impenemase (IMP) Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,Impenemase (IMP) Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaKPC,Klebsiella pneumoniae Carbapenam (KPC) Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,Klebsiella pneumoniae Carbapenam (KPC) Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaNDM,New-Delhi Metallo- (NDM) Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,New-Delhi Metallo- (NDM) Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaOXA48,OXA-type Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,OXA-type Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaSHV,SHV Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,SHV-type Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaTEM,TEM Beta-Lactamase-Resistance gene target,measurements,TEM-type Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blaVIM,Verone Integron-Encoded Metallo- (VIM) Beta-Lactamase-Resistance-resistance gene target,measurements,Verone Integron-Encoded Metallo- (VIM) Beta-Lactamase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bLacAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
blob,Binary Large Object (BLOB) data type,dataTypes,The data type for Binary Large Object (BLOB) data.,Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
boc,Breadth of coverage (>=5x depth),units,Positions with read depth greater or equal to 5.,Report as percentage of positions.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,Issue #120,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,100,NA,NA
bod5c,5-Day carbonaceous biochemical oxygen demand,measurements,"The quantity of oxygen utilized for the biochemical degradation of organic matter under standard laboratory procedures in five (5) days in the presence of a nitrification inhibitor, expressed in milligrams per litre (mg/l).",NA,bio,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,miscMeas,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi.org/10.1002/wer.1541,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
bod5t,5-day total biochemical oxygen demand,measurements,5 day total biochemical oxygen demand.,NA,bio,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,miscMeas,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi.org/10.1002/wer.1541,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
boolean,Boolean data type,dataTypes,The data type for boolean/binary data.,Encoded as 'TRUE' or 'FALSE',naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
booleanAggrSet,Boolean aggregation set,aggregationSets,Aggreagation set for boolean.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
booleanSet,Boolean value set,mmaSets,Set that contains the valid possible values for a boolean measure (TRUE or FALSE).,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,NA,NA,booleanAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
borreliaGrp,Borrelia burgdorferi or Lyme Disease Group,groups,A group of measures/methods related to Borrelia burgdorferi or Lyme Disease.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,borreliaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
brsv,Bovine respiratory syncytial virus group,measurements,Bovine respiratory syncytial virus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,rsvGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
brsvCul,brsv culture spike target,categories,Cultured bovine respiratory syncytial virus (BRSV) is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
brsvN,BRSV-N,measurements,bovine respiratory syncytial virus capsid protein gene region,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,rsvGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
brsvVac,brsv vaccine spike target,categories,The bovine respiratory syncytial virus (BRSV) vaccine is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
brucella,Brucella,measurements,Brucella,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,brucellaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
brucellaGrp,Brucella Group,groups,A group of measures/methods related to brucella bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,brucellaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
bsd0,BSD Zero-Clause license,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the BSD Zero-Clause license.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/0bsd/,varchar,NA,NA,0,30
bsd2Clause,"BSD 2-clause ""Simplified"" license",categories,"The licensing for the measure or data set is managed under the BSD 2-clause ""Simplified"" license.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/bsd-2-clause/,varchar,NA,NA,0,30
bsd3Clause,"BSD 3-clause ""New"" or ""Revised"" license",categories,"The licensing for the measure or data set is managed under the BSD 3-clause ""New"" or ""Revised"" license.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/bsd-3-clause/,varchar,NA,NA,0,30
bsd3ClauseClear,BSD 3-clause Clear license,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the BSD 3-clause Clear license.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/bsd-3-clause-clear/,varchar,NA,NA,0,30
bsd4Clause,"BSD 4-clause ""Original"" or ""Old"" license",categories,"The licensing for the measure or data set is managed under the BSD 4-clause ""Original"" or ""Old"" license.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/bsd-4-clause/,varchar,NA,NA,0,30
bsl10,Boost Software License 1.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Boost Software License 1.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/bsl-1.0/,varchar,NA,NA,0,30
bSwrPpl,Branch sewer pipleline,categories,"Specifies a site type that is collection pipe that run lateral to other municpal sewer lines, allowing drainage into the main sewer.",NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
buildCO,Building cleanout,categories,Specifies a site type that is a capped pipe that connects to a building's main sewer line.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mpxC3L,Clade I Mpox C3L Gene Target,measurements,Human MPox Virus (hMPXV) Clade I gene target. hMPXV C3L primers and‚ÄØprobe‚ÄØdetect Clade I viruses.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxCldIGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi:10.1016/j.jviromet.2010.07.012,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
caff,Caffeine,measurements,Caffeine (usually measured as a human fecal chemical indicator),NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
Calprotectin,Calprotectin ,measurements,Calprotectin is a calcium- and zinc-binding protein of the S-100 protein family which is mainly found within neutrophils and throughout the human body. The presence of calprotectin in faeces is a consequence of neutrophil migration into the gastrointestinal tissue due to an inflammatory process.,NA,bio,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,metaboliteGrp,protein,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,development,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
camp,Campylobacter,measurements,Campylobacter.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,campGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
campGrp,Campylobacter Group,groups,A group of measures/methods related to campylobacter bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,campGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
capacity,Capacity class,classes,Measures and methods relating to capacity.,NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,capacity,naNomenclature,NA,NA,NA,capacityUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
capacityUnitSet,Capacity unit set,unitSets,Unit set for capacity measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,capacityUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
capitalEndonym,Capital city endonym,attributes,The name locals use for their country’s capital.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
capitalExonym,Capital city exonym,attributes,The English name foreigners use for the country’s capital.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
caRepDate,Case report date,categories,"Date that the numbers were reported publicly. Typically, reported data and this measure is most commonly reported and used.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
caseEpDate,Episode date of confirmed cases ,units,"Episode date is the earliest of onset, test or reported date for a confirmed case.",NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
caseOnDate,Onset date of confirmed cases ,units,"Earliest that symptoms were reported for a confirmed case. This data is often not known and reported. In lieu, episode is used.",NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
caseRepDate,Report date of confirmed cases ,units,"Date that the numbers were reported publicly for a confirmed case. Typically, reported data and this measure is most commonly reported and used.",NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
caseTestDate,Test date of confirmed cases ,units,Date that the covid-19 test was performed for a confirmed case.,NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
categorical,Categorical data type,dataTypes,The data type for categorical data.,Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
categories,Categories,partType,"A discrete list of values that can be reported for a measure, method or attribute. ","A use-case example of categories would be how they are used to record the site where a measure is taken (partID = geoType). For the geoType attribute there are different type of sites where samples can be taken: a wastwater treatment plant, airplane holding tank, wastwater pumping station, etc. Each of these site types is recorded as a category that can be identified in categorySetID = sTypeCatSets",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
cAuris,Candida auris,measurements,"The yeast species Candida auris, or C. auris.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,cAurisGrp,bacteria,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cAurisGrp,Candida auris Group,groups,A group of measures/methods related to Candida auris.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,cAurisGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cbp,Carbapenemase-encoding genes,measurements,Carbapenemase-encoding genes.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,amrGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cc010,Creative Commons Zero v1.0 Universal,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Creative Commons Zero v1.0 Universal.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/cc0-1.0/,varchar,NA,NA,0,30
ccby40,Creative Commons Attribution 4.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Creative Commons Attribution 4.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/cc-by-4.0/,varchar,NA,NA,0,30
ccbysa40,Creative Commons Attribution ShareAlike 4.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Creative Commons Attribution ShareAlike 4.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/cc-by-sa-4.0/,varchar,NA,NA,0,30
ccc,Long-term acute care hospital,categories,"Acute care hospitals, or complex contuing care, that provide care for patients with average length of stay longer than 25 days.",NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdc,Child day care,categories,Child day care facility.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovEIDTFor,Sarbeco_E forward primer (IDT),categories,Sarbeco_E forward primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovEIDTProbe,Sarbeco_E probe (IDT),categories,Sarbeco_E probe (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovEIDTRev,Sarbeco_E reverse primer (IDT),categories,Sarbeco_E reverse primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN1IDTFor,2019-nCoV_N1 forward primer (IDT),categories,2019-nCoV_N1 forward primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN1IDTProbe,2019-nCoV_N1 probe (IDT),categories,2019-nCoV_N1 probe (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN1IDTRev,2019-nCoV_N1 reverse primer (IDT),categories,2019-nCoV_N1 reverse primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN2IDTFor,2019-nCoV_N2 forward primer (IDT),categories,2019-nCoV_N2 forward primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN2IDTProbe,2019-nCoV_N2 probe (IDT),categories,2019-nCoV_N2 probe (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN2IDTRev,2019-nCoV_N2 reverse primer (IDT),categories,2019-nCoV_N2 reverse primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN3IDTFor,2019-nCoV_N3 forward primer (IDT),categories,2019-nCoV_N3 forward primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN3IDTProbe,2019-nCoV_N3 probe (IDT),categories,2019-nCoV_N3 probe (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cdcCovN3IDTRev,2019-nCoV_N3 reverse primer (IDT),categories,2019-nCoV_N3 reverse primer (IDT),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cDiff,Clostridium difficile,measurements,Clostridium difficile,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,clostridiumGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cDip,Corynebacterium diphtheriae,measurements,Corynebacterium diphtheriae,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,diptheriaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cecill21,CeCILL Free Software License Agreement v2.1,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the CeCILL Free Software License Agreement v2.1.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/cecill-2.1/,varchar,NA,NA,0,30
cel,Degrees Celcius,units,Degrees Celsius.,NA,phy,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$^{\circ}C,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.1.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,-60,100,NA,NA
cent,Centrifugation,categories,Describes solid separation from a wastewater sample via centrifugation. Likely connected to other method steps prior to analysis.,NA,allDo,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
centriconUf,Centricon ultrafiltration,categories,Centricon ultrafiltration.,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
centSpeed,Centrifugation speed,measurements,Centrifugation speed,NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,speed,naNomenclature,NA,NA,NA,speedUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ceres,Ceres nanotrap,categories,Ceres nanotrap.,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cfu,CFU per 100 ml,units,Colony forming units per 100 ml of filtered sample.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$CFU/{100~ml}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.1.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
chlamydiaGrp,Chlamydia Group,groups,A group of measures/methods related to chlamydia bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,chlamydiaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
changes,Changes column,tableSupport,A column for recording the changes from a previous version.,Use this column as a short-hand change log for dictionary development.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,12,header,optional,9,header,optional,24,header,optional,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
charLength,character length,attributes,The number of characters used for the wide names.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,3,NA,varchar,NA,NA,0,30
che,Chemical,domains,A chemical compound.,NA,che,anySpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
chemVir,Chemagic viral dna/rna 300 kit,categories,Nucleic acid extraction performed using the chemagic viral dna/rna 300 kit.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
chikungunyaGrp,Chikungunya Group,groups,A group of measures/methods related to chikungunya virus.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,chikungunyaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
chikv,Chikungunya virus (CHIKV),measurements,Chikungunya virus (CHIKV),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,chikungunyaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
child,Child relationship,categories,Indicated that this is a sample generated from (an)other sample(s) either because of pooling or sub-sampling.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,changed to a relationshipID value.,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
chlamydia,Chlamydia,measurements,Chlamydia,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,chlamydiaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
city,City,attributes,The city where a site or organization is located; part of the address.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cJejuni,Campylobacter jejuni bacteria,measurements,Campylobacter jejuni gene target/measurement,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,campGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0882401017303728?via%3Dihub,varchar,NA,NA,0,30
cK,Composite Key,categories,Composite key for a table.,"All report tables have a primary key - the composite key acts as a primary key, but it prouced as a combination of other fields. Each row in a report table has unique identifier recorded in the primary key/composite key. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
clari,Clarified sample,categories,Clarified sample.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
class,Class,attributes,"A unique identifier for a class, which is akin to a sub-group; it's a way of grouping parts within a given group. A group can have one or more classes to describe different parts of the class. ","Currently, class is only used for biologics. For example, SARS-CoV-2 is a group of measures with the following classes of allele, variant, mutation, sequence, and protein.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,16,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
classes,Classes,partType,A class is a collection of one or more related measures or methods within a group. A group can have one more more classes to describe different parts or the class. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
clostridiumGrp,Clostridium Group,groups,A group of measures/methods related to clostridium bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,clostridiumGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cloudy,Cloudy,categories,"Qualitative category for the weather measure, specifying an overcast day with no rain.",NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #124 and #204,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cm,Centimetres,units,Unit part for the SI unit of centimetres.,NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cm$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
co,Contact table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the The table that contains information about a contact; a person who is the contact of a site or laboratory.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
co2,Carbon Dioxide ,measurements,A measure of an amount or concentraion of carbon dioxide.,NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,miscMeas,gas,naNomenclature,NA,NA,NA,dissGasUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #202,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cod,Chemical Oxygen Demand,measurements,Chemical oxygen demand.,NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,waterQualityGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
col2Frdg,Time from collection to storage,measurements,The amount of time between sample collection and the samples placement in stable storage/refrigeration.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,time,naNomenclature,NA,NA,NA,timeUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
colAMRGrp,Colistin Anti-microbial resistance group,groups,The group for measures and methods pertaining to colistin-related anti-microbial resistance.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,colAMRGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,50
colGrp,Collection group,groups,A group of measurement-like attributes related to sample collection.,NA,allDo,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
colis,Colistin resistance,measurements,Colistin-resistant bacteria.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,amrGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
collDT,Collection date time,attributes,"For grab samples this is the date, time and timezone the sample was taken.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,Update in line with Github Issue #211,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,15,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
collDTEnd,Collection date time end,attributes,"For integrated time average samples this is the date, time and timezone the sample was finished being taken.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,Update in line with Github Issue #211,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,17,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
collDTStart,Collection date time start,attributes,"For integrated time averaged samples this is the date, time and timezone the sample was started being taken.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,Update in line with Github Issue #211,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,16,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
collectSet,Sample collection set,mmaSets,Methods for collection samples. ,"Sample collection methods include water, air, and surface. See the attribute `Compartment set` of the sample collection method.",naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,collectSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
collNum,Collection number,attributes,"The number of subsamples that were combined to create the sample. Use NA for continuous, proportional or passive sampling.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,13,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
collNumPer,Collection period and number ,attributes,Composite collection number.period.,"This a composite measure that combines `collection period` (collPer) and `collection number` (collNum). Collection number and period can be used to reduce the number of table headings during data collection. In data storage, `collNum` and `collPeriod` should be transformed to `collPer` and `collNum`. For Grab sample, Surface swab, or Area proportional sample just enter 1
In case of Composite, Flow-proportional collection, the number of subsamples followed by a dot, followed by the period of the sampling, in hours.
For example, for 4 composite subsamples covering a 8 hours period, the entry would be 4.2
For time-proportional 24 subsamples collected every hour, the entry would be 24.1
For volume-proportional, the entry for 24 subsamples collected over 24 hours should be 24.24, in this case the period part of the entry should be understood as the total collection time instead of the periodicity of the collection.
For a COSCA ball or Moore swab collecting for 24 hours, the entry would be 1.24",naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,template,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,6
collPer,Collection period,attributes,"Collection period. The time period over which the sample was collected, in hours. Alternatively, use collectionStart and collectionEnd.","Examples: 1 hour, 6 hours, 24 hours",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,float,1,NA,NA,NA
collType,Sample collection type,attributes,The type of collection. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,collectSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,description wording,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fk,mandatory,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
colocated,Co-located sample,categories,"Second or multiples samples collected at same location but different time (water, air) or at a nearby location (soil, sediment). Sent blind to laboratory.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
columnNameDep,Column name depreciiated,attributes,Name for the column,Depreciated in ODM version 2. Look-up tables are now incoprated into parts and sets.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
commFacOth,Commercial facility - not specified,categories,Specifies a site type which is a commercial facility/worksite that is not otherwise captured or described in the geotype set.,NA,naDomain,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
comp,Composite sample - archival,categories,"A composite sample, usually generated by an autosampler.","This is intended for use in updating and mapping archival data into the newest version of the ODM. Generally, autosamplers do time or flow-proportional sampling, and so those collection methods should be used instead. This is only for composite/autosampler samples where these additional details have not yet been specified. Use collectionPeriod to describe how many hours the sample was taken, and collectionNum to record the number of samples.",naDomain,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
comp3,Composite grab sample of 3,categories,A grab-composite sample composed of 3 separate grab samples.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,Use grab with collection number (collectNum) = 3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
comp3dep,Composite grab sample of 3 depreciate,categories,A grab-composite sample composed of 3 separate grab samples.,"Deprecated in version 2, please do not use.",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, ""default"" entries are no longer in use.",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
comp3h,Composite 3hr grab sample,categories,"A 3-hour composite with 3 grab samples each taken once per hour, generally manually performed.",NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,Use grab with collection period (collectPer) = 3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
comp3hdep,Composite 3hr grab sample depreciate,categories,"A 3-hour composite with 3 grab samples each taken once per hour, generally manually performed.","Deprecated in version 2, please do not use.",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, ""default"" entries are no longer in use.",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
comp8h,Composite 8hr grab sample depreciated,categories,"An 8-hour composite with 8 grab samples each taken once per hour, generally manually performed.","Deprecated in version 2, please do not use.",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, ""default"" entries are no longer in use.",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
comp8hDep,Composite 8hr grab sample deprecated,categories,"A 8-hour composite with 8 grab samples each taken once per hour, generally manually performed.",NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,Use grab with collection period (collectPer) = 8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
compartment,Compartment,attributes,"The attribute identifying the substance from which where a sample was taken. For more information, see partID = compartment.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
compartmentInput,Compartment input (wide table),attributes,The partID for the compartment being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,15,NA,varchar,NA,NA,0,30
compartmentName,Compartment name (wide table),attributes,The compartment referenced for the wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,14,NA,varchar,NA,NA,0,30
compartments,Compartments,partType,The substance from which a sample was taken.,"For example, wastewater has component of ""water"". Compartments are attributes of measures, methods, units, and aggregations.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
compartmentSet,Compartment Set Header,attributes,An idenfication of a set of compartments that can be applied for a measure or method.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.2.2,2.2.2,added in 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
compartmentSets,Compartment sets,partType,Sets of compartments. ,"Compartment sets are used to identify when a measure can be recorded for more than one compartment. For example, SARS-CoV-2 can be measured in people (humans), water, surface, or air.",naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
conc,Concentration measure,measurements,Measurement of concentration (generalized) - designed for describing protocols.,NA,che,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,miscMeas,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
concurrent,Is concurrent to,categories,Specifies that the object step or protocol occurs at the same time as the subject step or protocol in the overall protocol container.,Use only for protocolRelationships table relationshipID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
concVol,Sample volume after concentration,measurements,The total volume of a sample after the concentration step.,NA,phy,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,volumeUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
cond,Water conductivity,measurements,Measurement of conductivity of sample or site.,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,siteFeat,conductivity,naNomenclature,NA,NA,NA,conductivityUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
conductivity,Conductivity class,classes,Measures and methods related to conductivity.,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,conductivity,naNomenclature,NA,NA,NA,conductivityUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
conductivityUnitSet,Conductivity unit set,unitSets,Unit set related to conductivity measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,conductivityUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
conf,Number of confirmed cases,units,Number of confirmed cases.,NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
confEp,Number of confirmed cases by episode date,units,"Number of confirmed cases of a given disease, totaled by episode date.","Episode date is the earliest of onset, test or reported date for a confirmed case.",bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
confOn,Number of confirmed Cases Onset date,units,"Number of confirmed cases of a given disease, totaled by onset date.","Onset date is the earliest date that symptoms were reported for a confirmed case. This data is often not known and reported. In lieu, episode is used.",bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
confRep,Number of confirmed cases by report date,units,"Number of confirmed cases of a given disease, totaled by report date.",Report date is the date that the numbers were reported publicly for a confirmed case. ,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
confTest,Number of confirmed cases test date,units,"Number of confirmed cases of a given disease, totaled by test date.",Test date is the date that the covid-19 test was performed for a confirmed case.,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$cases$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
contactID,Contact ID,attributes,A unique identifier for a given contact person.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,fK,optional,9,NA,NA,NA,header,optional,26,fK,optional,5,NA,NA,NA,fK,mandatory,9,fK,optional,4,NA,NA,NA,pK,mandatory,1,NA,NA,NA,fK,optional,6,header,optional,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
contactName,Contact name,attributes,"Contact person or group, for the lab.",Depreciated in ODM version 2. see 'name',naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, now use partID = firstName and partID = lastName instead",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
contacts,Contact table,tables,The table that contains information about a contact; a person who is the contact of a site or laboratory.,adapt from verson 1 documentation,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,programDescr,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,49,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
contactsOrder,Contacts table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in a Contacts table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,51,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
contactsRequired,Contact table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Contacts table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,50,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
contactTableSet,Contact table set,dictSets,"Tables are where measures, methods and attributes are recorded. Tables represent the main entities of the environmental surveillance.",NA,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
coPhone,Contact phone,attributes,"Contact phone number, for the lab.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,10,12
corFcil,Correctional facility,categories,Correctional facility,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cosca,COSCa ball,categories,COSCa passive sampling device.,Use collectionPeriod to describe how many hours the ball was used to collect the sample,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/ew/d1ew00207d,varchar,NA,NA,0,30
countries,Countries look-up tables,tables,Look up table for the possible country inputs.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,lookup,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,82,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
countriesOrder,Countries table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in the countries table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,84,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
countriesRequired,Counries table required headers,tableSupport,Required headers in the countries table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,83,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
country,Country,attributes,The country where a site or organization is located; part of the address.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
countryEndonym,Country endonym,attributes,The name locals use for their country.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
countryExonym,Country exonym,attributes,The English name foreigners use for the country.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
countryLevel,Countries or sovereign states,attributes,Countries or sovereign states,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,depreciated,2.0.0,2.1.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
countyLevel,"Districts, counties, regions",attributes,"Districts, counties, regions",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,depreciated,2.0.0,2.1.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cov,Covid-19,measurements,Covid-19 infection.,"Any form of Covid-19 human infetion - including testing for Covid-19, symptomatic Covid-19, asymptomatic Covid-19, hospitalized Covid-19, long-Covid-19, etc. If needed, define the specific form Covid-19 with units. See populationUnits.",bio,poSpecimenSet,humanCompartmentSet,sarsCov2,disease,icd,NA,NA,NA,populationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cov2Me,SARS-CoV-2 measure,measurements,Measure the amount of SARS-CoV-2 virus.,This measure should only be used if there is no other SARS-CoV-2 measure. See groupID = sarsCov2. Use a note to describe the specific measure used.,bio,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covB117,SARS-CoV-2-B.1.1.7,measurements,Variant B.1.1.7 of the SARS-CoV-2 virus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,pangolin,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covB135,SARS-CoV-2-B.1.351,measurements,Variant B.1.351 of the SARS-CoV-2 virus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,pangolin,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covE,SARS-CoV-2-E,measurements,SARS-CoV-2 E gene.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covN1,SARS-CoV-2-N1,measurements,"SARS-CoV-2 nucleocapsid gene, allele 1.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covN2,SARS-CoV-2-N2,measurements,"SARS-CoV-2 nucleocapsid gene, allele 2.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covN200,SARS-CoV-2-N200,measurements,"SARS-CoV-2 nucleocapsid gene, amino acids 199-202.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
covN3,SARS-CoV-2-N3,measurements,"SARS-CoV-2 nucleocapsid gene, allele 3.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covP1,SARS-CoV-2-P.1,measurements,Variant P.1 of the SARS-CoV-2 virus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,pangolin,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
covRdrp,SARS-CoV-2-RdRp,measurements,SARS-CoV-2 RdRp gene.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cPerfrigens,Clostridium perfringens,measurements,Clostridium perfringens,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,clostridiumGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cphDate,Covid-19 population measurement date,attributes,date of reporting for covid-19 measure.,Depreciated in ODM version 2. The measure identication is now measureReportID with report dates as for any measure report.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, measure identication is now found in partID = measureRepID, with date fields for any measure report. ",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cphid,Cphd ID,attributes,Unique identifier for the table.,Depreciated in ODM version 2. The measure identication is now measureReportID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, measure identication is now found in partID = measureRepID",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cra,crAssphage-N,measurements,crAssphage virus capsid protein gene region,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
crea,Creatinine,measurements,Creatinine (usually measured as a human fecal chemical indicator),NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
crosswalkTableSet,Crosswalk table set,dictSets,Tables used to translate to and from other environmental dictionaries and models.,NA,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cryptosporidium,Cryptosporidium,measurements,Cryptosporidium,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,cryptosporidiumGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
cryptosporidiumGrp,Cryptosporidium Group,groups,A group of measures/methods related to cryptosporidium parasites.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,cryptosporidiumGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ct,Cycle threshold or quantification cycle (Ct or Cq),units,Cycle thresholds in a PCR assay.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,standardCurve,naNomenclature,NA,$Ct$,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
cu,Countries look-up tables Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the Look up table for the possible country inputs.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cuCo,Cumulative count,aggregations,The cumulative count of cases of a given disease.,Aggregation for a population or disease measure to explain population-level clinical effects.,naDomain,poSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
custodyCont,Custody Contact ID,attributes,A unique identifier for data custodians.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,recommended,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
custodyID,Data custodian ID,attributes,The data custodian of a database. ,"Use Organization ID to populate this field, and the organizations table to describe contact information and other details for the data custodian. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #205,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cVDPV2,Circulating vaccine-derived poliovirus type 2,measurements,Circulating vaccine-derived poliovirus type 2,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,polioGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
cyNum,Number of cycles,measurements,"The number of cycles of a PCR machine, or any other cycling process.",NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
d339h,D339H Mutation,measurements,The FLiRT/SLip variant mutation D339H.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
d377y,d377y delta-variant gene target,measurements,d377y delta-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
d3g,d3g omicron-variant gene target,measurements,d3g omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
d63g,d63g delta-variant gene target,measurements,d63g delta-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
d796y,d796y omicron-variant gene target,measurements,d796y omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
d950n,d950n delta-variant gene target,measurements,d950n delta-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
daiCo,Daily count,aggregations,The daily count of cases of a given disease.,Aggregation for a population or disease measure to explain population-level clinical effects.,naDomain,poSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
dataColl,Data collection sector or organization,categories,"Describes organization who collect compile, analyze, and or manage data as their central focus.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,NA,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
datasetDate,Dataset creation date,attributes,Specifies the date a given dataset was created.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,recommended,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
datasetID,Dataset ID,attributes,"The name of the dataset that stores information for MeasureReport, SampleReport and other reporting tables.","Where possible, datasetID name should correspond the orignial data custodian responsible for generating environmental data. (suggestion for a default name convention.)",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #205,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,7,NA,NA,NA,pK,mandatory,2,fK,optional,3,fK,optional,8,fK,mandatory,2,fK,optional,2,fK,optional,5,fK,mandatory,2,fK,optional,2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
datasets,Dataset table,tables,A report table for capturing details about data's parental data set and data custodians. Supplying attribution for data collectors.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,programDescr,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,37,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
datasetsOrder,Datasets table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in a Datasets table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,39,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
datasetsRequired,Dataset table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Datasets table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,38,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dataTypes,Data types,partType,The data type for a part.,"Data types used in the ODM include: varchar, booleen, float, category, date, time, datetime, url, email. dataType corresponds the the entry or cell within a data table, most commonly within a report table. If the data entry has a unit, then the dataType corresponds to the unit and the dataType refers to 'unit'. If the data entry is a category, then the dataType refers to 'category'. All categories are varchar. Otherwise the dataType is identifed within the part entry. TBA: dataType for dictionary.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,92,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
date,Date,attributes,Date,date on which the assayMethod was created or updated (for version update).,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciate, update in line with Github Issue #211",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
datetime,Datetime data type,dataTypes,The data type for date and time data.,Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
days,Days,units,A unit for indicating a length of time in days.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,time,naNomenclature,NA,$days$,NA,timeUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
ddcovE,ddcov_e sars-cov-2 gene target,measurements,ddcov_e sars-cov-2 gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ddcovN,ddcov_n sars-cov-2 gene target,measurements,ddcov_n sars-cov-2 gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ddpcr,Digital Droplet PCR (ddPCR),categories,Describes a PCR analysis done using digital droplet PCR technology (general).,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
death,Deaths,units,Units for describing a population measure of patients who have died from a given cause.,Unit for a population or disease measure to explain population-level clinical effects.,bio,poSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
del142144,Omicron Variant 142-144 Deletion,measurements,Omicron Variant 142-144 Deletion,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del143,del143/145,measurements,143 or 145 deletion omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del156157,Delta Variant 156-157 Deletion,measurements,Delta Variant 156-157 Deletion,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,deltaGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del157,del 157/158,measurements,157 or 158 deletion delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del2084,del2084/2084,measurements,2084 or 2084 deletion omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del212,del212/212,measurements,212 or 212 deletion omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del3133,Omicron Variant 142-14431-33 Deletion,measurements,Omicron Variant 142-14431-33 Deletion,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del3674,del3674/3676,measurements,3674 or 3676 deletion omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
del6970,del69/70,measurements,69 or 70 deletion omicron-variant gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
delta,Delta,measurements,B.1.617.2,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
deltaGrp,SARS-CoV-2 Delta Variant Group,groups,A group of measures/methods related to the SARS-CoV-2 Delta Variant.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,deltaGrp,naClass,naNomenclature,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C169076,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
denat,denaturation,categories,Describes the denaturation cycle in a PCR process.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dengue,Dengue,measurements,Dengue,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flavivirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
depreciated,Depreciated,categories,Indicator to say that a part is no longer in current use in the model. See partID = status,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
derived,Derived sample,categories,A sample that is derived or made from another sample or material.,"A derived sample is a type of sample created by mixing material obtained from a field sample (e.g., wastewater, soil, or air) with additional additives in a laboratory setting. This process can involve diluting the original field sample with clean water or other solutions, as needed. Derived samples are typically used to adjust the concentration of the target substance or organism, making it more suitable for analysis or to test the efficiency and sensitivity of detection methods. In the example given, a derived sample might be a sub-sample of wastewater that is diluted with clean water to achieve a specific concentration, allowing for more accurate and reliable analysis.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
descr,Description,attributes,"A detailed description of a measure, method, or attribute.",A description of the part that serves a clear presentation of the part to a wide audience including techinical and not techincal staff. A description should allow any person who generates environment surveillance data to know how to identify how to record their data elements in the ODM. partReference can be used to further describe a part.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,6,header,optional,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,3,header,optional,8,header,optional,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,4,NA,varchar,NA,NA,0,200
descrChange,Description of change,tableSupport,A description of change in a part from the previous version.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
desk,Desk or counter,categories,"Desk, table, countertop or other flat working surface.",NA,naDomain,naSpecimenSet,surfaceCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
deso,Dewatered solids,categories,Dewatered solids.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
det,Detected,units,Substance detected or not detected.,"TRUE = detected, FALSE = not detected",bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$detected$,booleanSet,naUnitSet,quantAggScale,booleanAggrSet,measQualitySet,NA,active,1.1.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,boolean,0,1,NA,NA
detailsDep,Access to details deprecated,attributes,More details on the existing confidentiality requirements of this measurement.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, sharing moved to sharing schema",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,1
development,Development,categories,Indicator that a part is under development use. See partID = status,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dictionaryRefTableSet,Dictionary reference table set,dictSets,Reference or look-up tables.,"For example, the parts table describe all elements of the ODM, including tables, table headers, measures, methods, categories, and units. sets are collections of parts. For example, units can be grouped together in a unitSet. languages and translations support translations.",naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dictionarySupport,Additional dictionary sheets,partType,Additional sheets for the Excel version of the ODM dictionary.,Sheets or tabs for the ODM Excel dictionary include: all ERD tables (look-up tables and data entry tables) and additional supportig tables. ,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
dictSets,Dictionary set type,partType,Sets used to describe and group dictionary tables.,NA,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,NA,NA
dilFact,Dilution factor,measurements,Specifies the extent to which a sample or aliquot was diluted prioir to analysis.,"Dilution factor is reported as a unitless measure, where a value of 10 indicates a 10:1 dilution.",allDo,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,dilution,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
dillute,Point dillutions,measurements,Exact concentration or dillutions for generating a standard curve.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,dilution,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
dilution,Dilution Class,classes,Measures and methods relating to dilutions.,NA,phy,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,dilution,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
diptheriaGrp,Diphtheria Group,groups,A group of measures/methods related to the diptheria bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,diptheriaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
disease,Diseases (human) class,classes,Measure and methods related to disease or infection in humans.,NA,bio,poSpecimenSet,humanCompartmentSet,naGroup,disease,icd,NA,NA,NA,populationUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dissGasUnitSet,Dissolved gas concentration unit set,unitSets,Unit set for carbon dioxide concentrations measurements in water or air.,NA,naDomain,naSpecimenSet,airWaterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,dissGasUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dna,DNA Template,categories,Deoxyribonucleic Acid (DNA) template is used for PCR or sequencing work.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
doc,Depth of coverage,units,The sequencing read depth.,Used to interpret the confidence in a presence or amount of a varient.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,Issue #120,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,100,NA,NA
domain,Domain,attributes,Domain is the highest level of describing of a measure.,"The domain ID that corresponds to a given part. Mostly applicable for measures, methods, units, and aggregations.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
domains,Domains,partType,"There are three domain types: biologic (i.e. Covid-19, chemical (i.e. nitrogen), physical measure (temperature).",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
dorm,Higher education domitory or residential building,categories,Higher education domitory or residential building,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
dpcr,Digital PCR (dPCR),categories,Describes a PCR analysis done using digital PCR technology (general).,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ds,Dataset table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the A report table for capturing details about data's parental data set and data custodians. Supplying attribution for data collectors.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
duration,Duration time of a method,measurements,The duration of time for a given method as described in protocols.,NA,naDomain,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,time,naNomenclature,NA,NA,NA,timeUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
e156g,e156g delta-variant gene target,measurements,e156g delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
e484a,e484a omicron-variant gene target,measurements,e484a omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mpxe9lNVAR,Mpox & Orthopox E9L-NVAR Gene Target,measurements,Human MPox Virus (hMPXV) gene target for Orthopoxvirus DNA polymerase. CDC Assay detects all hMPXV‚Äã clades and non-variola Orthopox viruses.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi.org/10.1016/j.jcv.2006.03.012,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mpxe9lOPX3,Mpox & Orthopox E9L-OPX3 Gene Target,measurements,Human MPox Virus (hMPXV) gene target using the generic orthopox virus OPX3. Lower sensitivity for MPox.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi.org/10.4269/ajtmh.2010.09-0716,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
eaec,Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC),measurements,Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ebv,Epstein–Barr virus (EBV),measurements,"Epstein–Barr virus (EBV), formerly known as Human gammaherpesvirus 4",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,herpesGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ecl20,Educational Community License v2.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Educational Community License v2.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/ecl-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
ecoli,Escherichia coli,measurements,"Concentration of bacteria that are passed through the faecal excrement of humans, livestock and wildlife",NA,bio,siSaSpecimenSet,surfaceWaterCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ecoliGrp,Escherichia coli group,groups,A group of measures/methods related to Escherichia coli bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
education,Education,categories,A measure or sample taken for education or training.,"Use this purpose, for example, when teaching how to use the PHES-ODM.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,Input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
efficient,Efficiency,units,The efficiency reported for a standard curve.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,standardCurve,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
ehec,Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC),measurements,Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
eiec,Enteroinvasive Escherichia coli (EIEC),measurements,Enteroinvasive Escherichia coli (EIEC),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
eluate,Eluate/Resuspended filter material retained,categories,"The eluate fraction, or material resuspended from filtration, is retained after solid separation/centrifugation.",NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,NA,NA,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
elutionBuff,Elution buffer,categories,Elution buffer is used to resuspend material.,NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,NA,NA,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
email,Contact email,attributes,"Contact e-mail address, for the lab.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
enaMap,European Nucleotide Association,attributes,ENA header,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
enaNotes,European Nucleotide Association (ENA) - notes,attributes,ENA notes,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
enterovirus,Enterovirus,measurements,Enterovirus,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,enterovirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
enterovirusGrp,Enterovirus Group,groups,A group of measures/methods related to enteroviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,enterovirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
enumeration,Enumeration for set values,attributes,"The numeric value that corresponds to a given value in a set, defined in the sets table.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,0,100,NA,NA
envRnF,Rainfall,measurements,"Rainfall, i.e. amount of precipitation in the form of rain.",NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,precipitation,naNomenclature,NA,NA,NA,precipitationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
envSnwD,Ground snow depth,measurements,Total depth of snow on the ground.,NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,precipitation,naNomenclature,NA,NA,NA,precipitationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
envSnwF,Snowfall,measurements,"Snowfall, i.e. amount of precipitation in the form of snow.",NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,precipitation,naNomenclature,NA,NA,NA,precipitationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
epec,Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC),measurements,Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
epiDate,Episode date,categories,"Episode date is the earliest of onset, test or reported date.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciate,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
epl10,Eclipse Public License 1.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Eclipse Public License 1.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/epl-1.0/,varchar,NA,NA,0,30
epl20,Eclipse Public License 2.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Eclipse Public License 2.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/epl-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
erdTableSet,ERD table set,dictSets,All tables listed in the Entity Relationship Diagram. ,"The full ODM model is commonly referred to as ""long"" tables as it stores data with one measurement per row.",naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
eSarbec,Sarbecovirus-specific E sars-cov-2 gene target,measurements,Sarbecovirus-specific E sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
esbl,ESBL-encoding genes,measurements,Extended-spectrum beta-lactamase-encoding genes.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,amrGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,bacteriaUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
esp,exclusions based sample preparation (ESP),categories,exclusions based sample preparation (ESP),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
estFreqReads,Estimated frequency of reads,measurements,Estimated frequency of reads in a sequencing assay,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,sequence,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
estuary,"Estuary, natural water body",categories,"Estuary, natural water body",NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
etec,Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC),measurements,Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
eupl11,European Union Public License 1.1,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the European Union Public License 1.1.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/eupl-1.1/,varchar,NA,NA,0,30
eupl12,European Union Public License 1.2,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the European Union Public License 1.2.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/eupl-1.2/,varchar,NA,NA,0,30
exceptions,Exception Part Type,partType,An exception part type for use in creating wide names that do not follow the general structure.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
expec,Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC),measurements,Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,ecoliGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
expFail,Experiment Failed,qualityIndicators,PCR experiment failed. No value reported.,Value should be blank for a measure with this qualityFlag value.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
extBlank,Extraction Blank - Control,methods,Binary Y/N indicator for if extraction blank was used as a control for the nucleic acid extraction process.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,unitlessUnitSet,qualAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,30
extract4s,4s method,categories,Nucleic acid extraction performed using the 4s method.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.protocols.io/view/v-4-direct-wastewater-rna-capture-and-purification-bpdfmi3n,varchar,NA,NA,0,30
extraction,Nucleic acid extraction method,methods,Description of the nucleic acid extraction method.,Description of the method used to extract the sample,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,extractSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,description wording add categories from NWSS,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,100
extractSet,Nucleic Acid Extraction set,mmaSets,set used for storing all the valid category values for the nucleic acid extraction method.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,extractSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
exvol,Extraction volume of sample,measurements,Extraction volume of sample.,Size of the sample that is analyzed.,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,physical,naNomenclature,NA,NA,NA,volumeUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,description wording and unit set,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
f456l,F456L Mutation,measurements,The FLiRT/SLip variant mutation F456L.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
faeces,Fecal matter,categories,Fecal matter.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fDNA,F+ DNA coliphage,measurements,F+ DNA coliphage,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
field,Field sample,categories,Specifies a sample taken from the field; directly collected from an area for testing.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fieldReplicate,Field sample replicate,categories,A sample divided into two or more homogeneous parts.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fileLocation,File location of polygon,attributes,The location of the file containing the geometry of the polygon.,"File path specified, or a URL",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"partID chaned to ""fileLoaction"" specifying where the file is, not the whole file itself.",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,blob,NA,NA,0,65535
filt,Filtration,categories,Describes solid separation from a wastewater sample via filtration. Proceeds further concentration or analysis of the liquid filtrate.,NA,allDo,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fiNa,First Nation,categories,"Used to categorize a sampleshed that is a First Nation, or on reserve lands.","Likely for internal use only, Indigenous data can and should not be shared without explicit consent of the nation in quesiton.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
finVol,Final volume,measurements,The final volume of a testing solution or sample.,NA,che,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
firstName,First name of contact,attributes,Specifies the first name of a given contact.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
firstReleased,First released version,partSupport,The version in which a part was first released,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,10,header,mandatory,7,header,mandatory,22,header,mandatory,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fK,Foreign key,categories,Foreign key for a table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagAI,AI - Inhibition present but addressed,qualityIndicators,"The original sample was inhibited; however, the inhibition has been addressed through dilution. The reported concentration estimate is the updated result after addressing inhibition.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagB,B - Trace levels of contamination,qualityIndicators,Analytical result may be subject to “trace” levels of contamination; the target analyte was also detected in negative controls on the same run as the sample.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagFI,FI - Inhibition present and unaddressed,qualityIndicators,"The original sample was inhibited; however, the inhibition has not been successfully addressed. Therefore, no concentration estimate has been reported.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagJ,J - Weak signal extrapolation,qualityIndicators,Analytical result falls below the lowest concentration of the experiment-specific standard curve but above the y-intercept value; the reported value is based on the extrapolation of the standard curve in the non-linear region.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagND,ND - Non-detect,qualityIndicators,No amplification occurred in the reaction; non-detect.,"For the value of a non-detected measure, report the actual value even if it is below the limit of detection. The flag here ensures that it's recorded as a non-detect regardless. In instances where the original data doesn't record a value, but only has the flag, please populate the value field with either a 0 if dealing with variant percentages, and a 1 for all other purposes to further indicate a null result.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagUJ,UJ - Trace signal extrapolation,qualityIndicators,"Observed quantitation cycle is greater than the experiment-specific standard curve intercept value but evidence of clear amplification was present (i.e., “trace” signal observed); the reported value is based on the extrapolation of the standard curve in the non-linear region.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flagUQ,UQ - Unquantifiable,qualityIndicators,"Unquantifiable, Ct value exceeds the maximum value of the standard curve. There was a detect, but we cannot quantify it with certainty.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flavivirusGrp,"Flavivirus (West Nile, Dengue, Zika) Group",groups,A group of measures/methods related to flaviviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flavivirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flirtSLipGrp,FLiRT/SLip Variant Group,groups,The group for measures and methods pertaining to the FLiRT and SLip variants of SARS-CoV-2.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flirtV,FLiRT Variants,measurements,FLiRT is the name given to an entire family of COVID-19 subvariants that are gaining dominance. They've evolved from the JN.1 subvariant.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
float,Float data type,dataTypes,The data type for float data.,Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
floMean,Flow-normalized mean,aggregations,Mean measure normalized to wastewater flow.,"Mostly used for reporting specific alleles (N1, N2, E, etc.)",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
floor,Floor,categories,Floor of a building or room.,NA,naDomain,naSpecimenSet,surfaceCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
floRate,Flow rate,measurements,Wastewater volumetric flow rate at the sample collection location over the 24-hr period during which the sample was collected.," If only an instantaneous flow measurement is available, it may be reported in units of million gallons per day. ",phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,siteFeat,flow,naNomenclature,NA,NA,NA,flowUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
flow,Flow class,classes,Measures and methods related to flow.,NA,phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,flow,naNomenclature,NA,NA,NA,flowUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flow24hDep,Flow proportional 24hr sample depreciated,categories,A flow proportional 24-hour composite sample generally collected by an autosampler.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
flowPr,Flow proportional sample,categories,A flow proportional composite sample generally collected by an autosampler.,"Use collectionPeriod to describe how many hours the sample was taken. The volume of wastewater taken is proportional to the flow rate flowing at each instant of sampling. This is also called constant time, variable volume (CTVV).",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,Removed time period. Use collection period (collectPer) = 24 for 24hr sample,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
flowUnitSet,Volume flow rate unit set,unitSets,Unit set for volume flow measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,flowUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
flowVol,Flow volume,measurements,Volume of influent.,NA,phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,siteFeat,flow,naNomenclature,NA,NA,NA,flowUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
flu,Influenza virus measure,measurements,General influenza virus measure,This measure should only be used if there is no other influenza virus measure. See groupID = virusMisc. Use a note to describe the specific measure used. ,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluGrp,organism,naNomenclature,http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005812,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fluA,Influenza A virus,measurements,Influenza A virus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fluA1,Influenza virus A1,measurements,Influenza virus A1 type,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fluA1A2c,Influenza virus A1 and A2 combined,measurements,"Measure of influenza virus A1 and A2 combined, usually due to single fluorescence channel.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fluA2,influenza virus A2,measurements,influenza virus A2 type,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fluAGrp,Influenza A Virus Group,groups,A group of measures/methods related to Influenza A viruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fluB,Influenza virus B,measurements,Influenza virus B type,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluBGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fluBGrp,Influenza B Virus Group,groups,A group of measures/methods related to Influenza B viruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluBGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fluiDpcr,Fluidigm digital PCR,categories,Describes a PCR analysis done using FluidIGM's digital PCR technology.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
foggy,Foggy,categories,"Qualitative category for the weather measure, specifying a foggy or hazy day.",NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #124 and #204,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fraction,Fraction analyzed,attributes,Fraction of the sample that is analyzed.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,fractionSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,recommended,14,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
fractionInput,Fraction input (wide table),attributes,The partID for the fraction being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,19,NA,varchar,NA,NA,0,30
fractionName,Fraction name (wide table),attributes,The fraction analyzed referenced for the wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,18,NA,varchar,NA,NA,0,30
fractionSet,Sample fraction set,mmaSets,"set for the fraction of the sample (solid, liquid, etc.).",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,fractionSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
freyja,Freyja Script,categories,Freyja Script for sequencing.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://github.com/andersen-lab/Freyja,varchar,NA,NA,0,30
fRNABact,F-Specific RNA bacteriophages,measurements,A measure for amount of F-Specific RNA bacteriophages.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fRNAColi,F+ RNA coliphage,measurements,F+ RNA coliphage,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
frnaG2,"F-Specific RNA bacteriophages, G2",measurements,A measure for amount of G2 F-Specific RNA bacteriophages.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
frozen,Sample frozen,qualityIndicators,Sample was frozen before analysis or processing,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
fst,Field sample temperature,measurements,Temperature that the sample is stored at while it is being sampled. This field is mainly relevant for composite samples which are either kept at ambient temperature or refrigerated while being sampled.,NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,temperature,naNomenclature,NA,NA,NA,temperatureUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fTularensis,Francisella tularensis,measurements,Francisella tularensis,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,tularemiaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
fullDictionarySheetSet,Full dictionary sheets set,dictSets,Worksheets in the full Excel dictionary.,The full dictionary is `ODM_full-dictionary.xlxs,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
funderCont,Funder contact ID,attributes,A unique identifier for a funder.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,recommended,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
funderID,Funding agency ID,attributes,The funding agency of the dataset.,"Use Organization ID to populate this field, and the organizations table to describe contact information and other details for the funding agency. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #205,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
g215c,g215c delta-variant gene target,measurements,g215c delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mpxG2RG,Mpox G2R-G Gene Target,measurements,Human MPox Virus (hMPXV) gene target using the G2R_G primers and‚ÄØprobe which ‚ÄØdetects all MPox Virus strains‚ÄØ‚Äã.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2010.07.012,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mpxG2RWA,Clade II Mpox G2R-WA Gene Target,measurements,"Human MPox Virus (hMPXV) Clade II gene target, measured with G2R_WA primers and probe to detects Clade II viruses.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxCldIIGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://doi:10.1016/j.jviromet.2010.07.012,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
g339d,g339d omicron-variant gene target,measurements,g339d omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
g496s,g496s omicron-variant gene target,measurements,g496s omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
g662s,g662s delta-variant gene target,measurements,g662s delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
gam,Gamma,measurements,P.1,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
gas,Gas class,classes,Measures and methods relating to gas and gases.,NA,che,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,gas,naNomenclature,NA,NA,NA,dissGasUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
gc,Gene copies,units,Gene or variant copies,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$gc$,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
gcCrA,Gene copies per copy of crAssphage,units,Gene or variant copies per copy of crAssphage.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$gc/{gc_{CrA}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
gcD100,"gene copies per day per 100,000 people",units,"The unit for measures reflecting the gene copies per day per 100,000 people in the population.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,Input,NA,NA,NA,NA,NA,Input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
gCGS,Gene copies per gram solids,units,Gene or variant copies per gram solids.,NA,bio,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$gc/{g_{solids}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
gcL,Gene copies per L,units,Gene or variant copies per litre.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$gc/{l}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
gcMl,Gene copies per mL,units,Gene or variant copies per millilitre of solution.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$gc/{ml}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
gcPpmov,Gene copies per PMMoV copy,units,Gene or variant copies per copy of PMMoV.,NA,bio,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$gc/{gc_{PMMoV}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
geneticUnitSet,Genetics unit set,unitSets,Unit set for genetic-related measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
genMissingnessSet,General missingness set,missingnessSets,The general set for missingness values.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
genQualitySet,Generic quality flag set,qualityIndSets,A quality set to specify any generic quality concerns about a measure or sample.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
geoEPSG,European Petroleum Survey Group Coordinates,attributes,The unique EPSG code specifying a given geospatial area.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,miscAttr,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,18,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
geoLat,Latitude,attributes,"Geographical location, latitude in decimal coordinates, ie.: (45.424721)",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,miscAttr,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,16,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,float,-90,90,NA,NA
geoLong,Longitude,attributes,"Geographical location, longitude in decimal coordinates, ie.: (-75.695000)",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,miscAttr,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,17,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,float,-180,180,NA,NA
geoType,Type of geography,attributes,Type of geography that is represented by the polygon.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,geoTypeSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
geoTypeSet,Geographic set,mmaSets,set for different type of geographic components.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,geoTypeSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
geoWKT,Well-known text,attributes,Well-known text of the polygon,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,63
gfdl13,GNU Free Documentation License v1.3,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the GNU Free Documentation License v1.3.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/gfdl-1.3/,varchar,NA,NA,0,30
gm3,Gram per cubic metre,units,Density unit.,Used for absolute humidity and other measures.,allDo,anySpecimenSet,airCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$g/m^3$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
gmn,Geometric mean,aggregations,Geometric mean.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
gonococcusGrp,Gonococcus Group,groups,A group of measures/methods related to gonococcus bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,gonococcusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
govt,Government agency,categories,"The category of organization type used for government agencies, programs, or crown-owned bodies.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
gpl20,GNU General Public License v2.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the GNU General Public License v2.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/gpl-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
gpl30,GNU General Public License v3.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the GNU General Public License v3.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/gpl-3.0/,varchar,NA,NA,0,30
grams,Grams,units,A unit of mass or weight.,NA,phy,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$g$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,Input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
graSet,Gravity settling,categories,"Describes solid separation from a wastewater sample where the sample material is allowed to settle by gravity, and then separated.",NA,allDo,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
grb,Grab sample,categories,A single large representative grab sample.,"If the sample was collected over a series of hours or is a composite sammple, please use partID = comp",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,sampleQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
gromstole,Gromstole 1.0 Script,categories,Gromstole 1.0 Script for sequencing.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://github.com/PoonLab/gromstole,varchar,NA,NA,0,30
group,Group,attributes,"Unique identifier for a group of measures. Mostly applicable for measures, methods, units, and aggregations.","A collection of related measures. For example, SARS-CoV-2 is a group. Within the SARS-CoV-2 group, there are measure classes tht include RNA alleles (N1, N2, E, etc.), mutations, (E484K0), an entire sequence, viral proteins, etc. Currently groups are used for measures only.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,15,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
groups,Groups,partType,A collection of related measures.,"Used primary to group measurements and methods, this helps pare down the drop down list for a given measurement or ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
mpxGTmol,Mpox GT Molecular Gene Target,measurements,Human MPox Virus (hMPXV) gene target - this specific measure and gene target are proprietary to GT Molecular,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
h5hema,Influenza A H5 hemagglutinin gene,measurements,"Measure of the H5 hemagglutinin gene from the Highly Pathogenic Avian Influenza Virus (HPAIV), the H5N1 Influenza A Virus (IAV) subtype.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
h5n1,H5N1 avian influenza A virus (IAV),measurements,"General measurement for the Highly Pathogenic Avian Influenza Virus (HPAIV), the H5N1 Influenza A Virus (IAV) subtype.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
haemophilusGrp,Haemophilus Group,groups,A group of measures/methods related to haemophilus bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,haemophilusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hAg,See Header for Aggregation,aggregations,An indicator to show in a wide-name that aggregation information is located in a different column.,Not a valid value for aggregation in the standard long-format.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hCo,See Header for Compartment ,compartments,A indicator for wide-names that the compartment information is stored in a separate column.,Not a valid value for compartment in the standard long-format.,naDomain,naSpecimenSet,wideCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
hDucreyi,Haemophilus ducreyi,measurements,Haemophilus ducreyi,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,haemophilusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
header,Header,categories,Header for a table. Also known as a table variable or entiy relationship 'attribute'. ,Header is the top row or the variable name in a table.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
healthAdm,Health administration or planning agency,categories,Health adminstrative or planning organization. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
healthRegion,Health Region for a Site,attributes,A free-text variable for listing the health region for a given site.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,14,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
heatInacSARS,Heat inactivated sars-cov-2 virus spike target,categories,Heat inactivated SARS-CoV-2 virus is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hepA,Hepatitis A,measurements,Hepatitis A,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hepB,Hepatitis B,measurements,Hepatitis B,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hepC,Hepatitis C,measurements,Hepatitis C,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hepE,Hepatitis E,measurements,Hepatitis E,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hepGRna,hep g armored rna,measurements,Measure of the amount Hepatitis G Armored RNA.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hepGRnaMat,hep g armored rna spike target,categories,Hepatitis G armored RNA is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hepGrp,Hepatitis Group,groups,A group of measures/methods related to hepatitis viruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
herpesGrp,Herpes Virus Group,groups,A group of measures/methods related to herpes viruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,herpesGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hf183,HF183 Bacteriodes 16S,measurements,Human-Specific HF183 Bacteriodes 16S rRNA,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,bacteroidesGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hFr,See Header for Fraction Analyzed,categories,An indicator in wide-names to show that information on the fraction analyzed in found under a separate header.,Not a valid value for fraction analyzed in the standard long-format.,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hiaa5,5-hydroxyindoleacetic acid (5-HIAA),measurements,"A serotonin metaboliteused for normalizing wastewater surveillance signal. Analysis of 5-HIAA is done in clinical settings to assess the possibility of carcinoid syndorme in patients, and used in wastewater analysis to estimate human population numbers. Studies have shown that 5-HIAA can be quanitified in samples from WWTPs, and that measured quantities of this molecule have a positive correlation with the population calculated using hydrochemical parameters, and are also correlated well with the census population measures.",NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
high,High severity,categories,"Indicates a very sever quality issue, likely meaning the data should not be reported.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,Input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hInfluenzae,Haemophilus influenzae,measurements,Haemophilus influenzae,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,haemophilusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hiv,Human Immunodeficiency Virus (HIV),measurements,Human Immunodeficiency Virus (HIV),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hivGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hivGrp,HIV Group,groups,A group of measures/methods related to Human Immunodeficiency Virus (HIV).,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hivGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hlthReg,Sewer Network Health Region,categories,Health region served by the sewer network,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,Name Change (from Polygon Type),NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hma,Hand Measurement,categories,Handheld measurement analyzer.,A handheld measurement analyzer.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hMe,See Header for Measure,measurements,An indicator to show in a wide-name that measure information is located in a different column.,Not a valid value for measure in the standard long-format.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hmpv,Human Metapneumovirus (HMPV) ,measurements,Human Metapneumovirus (HMPV) ,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hollowFiberUF,Hollow fiber dead end ultrafiltration,categories,Hollow fiber dead end ultrafiltration,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hosa,General Hospital Admissions,units,Hospital admissions or patients newly admitted to hospital.,NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$people$,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
hosc,Hospital Census,units,Hospital census or the number of people admitted with an ailment.,NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$people$,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
hosptl,Hospital,categories,Hospital,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hoTaWa,Holding tank wastewater depreciated,categories,"Wastewater from a holding tank, such as from an airplane or ship","Deprecated in version 2, please do not use. Duplicate of the sampleMat categories - refer to those.",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
hours,Hours,units,A unit for indicating a length of time in hours.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,time,naNomenclature,NA,$hours$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
hpiv,Human Parainfluenza Virus (HPIV),measurements,Human Parainfluenza Virus (HPIV),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,parafluGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hpv,Human Papiloma Virus (HPV),measurements,Human Papiloma Virus (HPV),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,papilomavirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hrv,Human Rhinovirus (HRV),measurements,Human Rhinovirus (HRV),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hrvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hrvA,Human Rhinovirus (HRV) A,measurements,Human Rhinovirus (HRV) A,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hrvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hrvB,Human Rhinovirus (HRV) B,measurements,Human Rhinovirus (HRV) B,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hrvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hrvC,Human Rhinovirus (HRV) C,measurements,Human Rhinovirus (HRV) C,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hrvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
hrvGrp,Rhinovirus Group,groups,A group of measures/methods related to rhinoviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hrvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hSp,See Header for Specimen,specimens,An indicator to show in a wide-name that specimen information is located in a different column.,Not a valid value for specimen in the standard long-format.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hsv,Herpes Simplex Virus,measurements,Herpes Simplex Virus,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,herpesGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
htSam,Holding tank wastewater,categories,"Wastewater sampled from a holding tank, such as from an airplane or ship",NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
htSite,Holding tank,categories,Holding tank,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hum,Human compartment,compartments,A measure or observation made about a human.,NA,bio,anySpecimenSet,humanCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
humanCompartmentSet,Human compartment set,compartmentSets,A compartment set for measures and methods in the human compartment.,NA,bio,anySpecimenSet,humanCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
humid,Humidity class,classes,Measures and methods related to humidity.,NA,phy,siSpecimenSet,airCompartmentSet,naGroup,humid,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
hUn,See Header for Unit,units,An indicator to show in a wide-name that unit information is located in a different column.,Not a valid value for unit in the standard long-format.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
i1566v,i1566v omicron-variant gene target,measurements,i1566v omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
i3758v,i3758v omicron-variant gene target,measurements,i3758v omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
i82t,i82t delta-variant gene target,measurements,i82t delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
iavM,Influenza A M gene,measurements,"A measure of the M gene found in Influenza A viruses (IAV). The virus has segmented RNA genome and 7th segment, M gene, encodes 2 proteins. M1 is a matrix protein and M2 is a membrane protein. The M gene may be involved in determining host tropism.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,"https://virologyj.biomedcentral.com/articles/10.1186/1743-422X-6-67#:~:text=The%20M%20gene%20of%20all%20known%20human%20influenza%20A%20viruses,of%20the%201918%20Spanish%20Flu.",seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ibu,Ibuprofen,measurements,Ibuprofen (usually measured as a human fecal chemical indicator),NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
icd,International Classification of Diseases,nomenclatures,Classification system for diseases in humans.,NA,bio,poSpecimenSet,humanCompartmentSet,naGroup,disease,icd,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
icu,Intensive care unit patients,units,Units for describing a population measure of patients who are in intensive care due to a given cause.,Unit for a population or disease measure to explain population-level clinical effects.,bio,poSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
in,Instrument table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the The table that contains information about instruments.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
index,Index,attributes,Index number in case the measurement was taken multiple times.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,22,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,28,NA,varchar,NA,NA,0,50
indusIn,Industrial input,measurements,Percentage of total wastewater input coming from industrial sources.,NA,phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,siteFeat,physical,naNomenclature,NA,NA,NA,volumeUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
influEqui,Influent equilibration,measurements,Binary indicator for whether a site stores influent wastewater prior to treatment to equilibrate flow rates.,NA,phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,siteFeat,physical,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,unitlessUnitSet,qualAggScale,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,30
inhibitionSet,Inhibition set,mmaSets,Category set for inhibition methods.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,inhibitionSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
inhibMe,Inhibition measure,measurements,Parameter to report whether or not inhibition was detected in the sample.,"Detected = TRUE, not detected = FALSE.",bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,miscMeas,sequence,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,structure change,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
inhibMeth,Inhibition method,methods,Description of the method used to evaluate molecular inhibition.,Description of the inhibition parameters.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,measGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,inhibitionSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,structure change,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,100
innovaprepUF,Innovaprep ultrafiltration,categories,Innovaprep ultrafiltration,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
input,Input,categories,Input for a table. Indicates if a part can be used in a table.,"“Input” is used to indicate if a part can be used as an entry in a table (something with partType = table). For example, covN1 is a specific measure that can be entered in the measureID field of the measures table. Therefore, covN1 is has a value ""input"" in the measures column in the parts list. ODM users can generate their own custom template by modifying using the value ""input"" for only the parts that are applicable for their program.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ins214epe,Omicron Variant ins214epe Insertion,measurements,Omicron Variant ins214epe Insertion,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
instrumentID,Instrument ID,attributes,A unique identifier for an instrument.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",fK,optional,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,pK,mandatory,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
instruments,Instrument table,tables,The table that contains information about instruments.,adapt from verson 1 documentation,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,programDescr,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,55,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
instrumentsOrder,Instruments table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in the Instruments table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,57,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
instrumentsRequired,Instrutment table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in the Instruments table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,56,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
instrumentTypeOther,Other instrument,categories,Type of instrument other than those included in the PHES-ODM.,An other type of measurement instrument. Add description to notes. See documentation for how to request new instruments added to the dictionary. ,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure, one of the two ""other"" field that was not depricated in the transition from V1 to V2",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
insType,Instrument Type,attributes,Type of instrument used to perform the measurement.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,insTypeSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,none,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
insTypeOth,"Describe other instrument type, if applicable",attributes,Description of the instrument in case it is not listed in instrumentType.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"none, one of the two ""other"" field that was not depricated in the transition from V1 to V2",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
insTypeSet,Instrument set,mmaSets,List of instruments that are used for measures and methods,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,insTypeSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
intAMRGrp,Integrase Anti-microbial resistance Group,groups,The group for measures and methods pertaining to integrase-related anti-microbial resistance.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,intAMRGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,50
integer,Integer data type,dataTypes,The data type for integers.,Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
integraseCl1,Integrase Class I gene target,measurements,Integrase anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,intAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
inter,Intercept,units,Intercept value of the calibration curve.,"Used for storing calibration curve information, potentially also applicable for other curve types.",allDo,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,standardCurve,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
ip2ip4,Combined ip2 and ip4 sars-cov-2 gene target,measurements,Combined ip2 and ip4 sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
isc,ISC,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the ISC license.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/isc/,varchar,NA,NA,0,30
iso6391,ISO639-1,attributes,The first part of the ISO 639 series of international standards for language codes. Part 1 covers the registration of two-letter codes. There are 183 two-letter codes registered as of June 2021. The registered codes cover the world's major languages.,Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
iso6392B,ISO639-2B,attributes,"A set of international standards that lists short codes for language names. These ISO639-2 are the three-letter codes defined in part two (ISO 639-2) of the standard, including the corresponding two-letter (ISO 639-1) codes where they exist. The 'B' specifies the bibliographic code (B code).",Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
iso6392T,ISO639-2T,attributes,"A set of international standards that lists short codes for language names. These ISO639-2 are the three-letter codes defined in part two (ISO 639-2) of the standard, including the corresponding two-letter (ISO 639-1) codes where they exist. The 'T' specifies the terminological code (T code).",Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
iso6393,ISO639-3,attributes,A set of international standards that lists short codes for language names. ISO 639-3 extends the ISO 639-2 alpha-3 codes with an aim to cover all known natural languages.,Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
iso6396,ISO639-6,attributes,"A set of international standards that lists short codes for language names. ISO 639-6 builds off ISO639-3 with the use of four-letter codes, and allowing users to differenciate between variants of languages and language families, such as histroical vs. revived versions of languages.",Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
isoCode,ISO 3166-1 alpha-2 country code,attributes,"The ISO 3166-1 alpha-2 code, a two-letter country code which is also used to create the ISO 3166-2 country subdivision code and the Internet country code top-level domain.","Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,PK,mandatory,1,FK,mandatory,1,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,2,2
isoCodeX,ISO 3166-1 alpha-3 country code,attributes,"The ISO 3166-1 alpha-3 code, a three-letter country code which may allow a better visual association between the code and the country names than the 3166-1 alpha-2 code.","Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,3,3
isoZone,ISO 3166-2 code for country sub-domain,attributes,"The ISO 3166-2 codes for the names of the principal subdivisions (e.g., provinces, states, departments, regions) of all countries coded in ISO 3166-1.","Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,PK,mandatory,2,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,4,6
jn17V,JN.1.7 Variant,measurements,"The JN.1.7 variant of SARS-CoV-2, one of the FLiRT variants.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
jn1V,JN.1 Variant,measurements,"The JN.1 variant is a subvariant of Omicron variant BA.2.86, and contains several mutations that are associated with escape from vaccine-mediated immune protection. The source of the FLiRT variants of SARS-CoV-2.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
k856r,k856r omicron-variant gene target,measurements,k856r omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
kgS,Kilogram per second,units,Kilograms per second.,NA,phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$kg/s$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
kl,Kilolitres,units,Kilolitres of volume,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$kl$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,Input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
klebsiellaGrp,Klebsiella Group,groups,A group of measures/methods related to klbsiella bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,klebsiellaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
klebsiellaPneu,Klebsiella pneumoniae,measurements,Klebsiella pneumoniae,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,klebsiellaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
kp11V,KP.1.1 Variant,measurements,"The KP.1.1 variant of SARS-CoV-2, one of the FLiRT variants.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
kp1V,KP.1 Variant,measurements,"The KP.1 variant of SARS-CoV-2, one of the FLiRT variants.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
kp2V,KP.2 Variant,measurements,"The KP.2 variant of SARS-CoV-2, one of the FLiRT variants.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
l,Litres,units,Litres of volume,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$l$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,New variable in category,Input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
l24s,Omicron Variant l24s mutation,measurements,Omicron Variant l24s mutation,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
l452r,l452r delta-variant gene target,measurements,l452r delta-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
l455s,L455S Mutation,measurements,The FLiRT/SLip variant mutation L455S.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,flirtSLipGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
l981f,l981f omicron-variant gene target,measurements,l981f omicron-variant gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
la,Language Look-up table Shorthand,shortName,"The abbreviated short name used to reference the Look up table for all languages, used to give structure to the translation table.",table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lab,Laboratory,categories,Laboratory for environmental testing.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
labDefDep,Lab ID default depricated,attributes,Used as default when a new sample is created by this reporter. See ID in Lab table.,"Deprecated as of version 2, no defaults please specify.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
labDuplicate,Laboratory duplicate ,categories,Second (time or more) processing and analysis of sample. Usually for general chemistry or metals analyses.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
label,Label,partSupport,A human readable label of a part.,"Typically, a part label has no acrynomns (every word is spelled out). Equivalent to a LOINC common name.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,4,header,mandatory,2,header,mandatory,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,2,NA,varchar,NA,NA,0,30
labID,Lab ID,attributes,Unique identifier for a laboratory.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.1.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
lagoon,Lagoon system,categories,Logoon system for extensive wastewater treatment,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lake,"Lake, natural water body",categories,"Lake, natural water body",NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lamba,Lambda,measurements,C.37,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
lang,Language ID,attributes,"Language code for translation purposes. Specifies the langage for each translation, other than the default English. Uses the ISO-6393 code.",Follow the ISO639-3 codes for now.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,pK,mandatory,1,fK,mandatory,2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
langFam,Language family,attributes,Specifies the language family of a given language for translation and language tracking purposes.,Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
langName,Language name,attributes,Specifies the name of the language in roman alphabet characters for translation and language tracking purposes.,Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
langScript,National language script,attributes,The language(s) and script(s) used for the country’s capital endonyms.,"The scripts are listed in parenthesis, in the order of their appearance. Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
languages,Language Look-up table,tables,"Look up table for all languages, used to give structure to the translation table.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,lookup,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,61,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
languagesOrder,Language table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in the Languages table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,63,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
languagesRequired,Language table required headers,tableSupport,Required headers in the Languages table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,62,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lastEdited,Last edited,attributes,The date the entry was last updated.,"Use lastEdited if an entry is updated. Leave lastEdited blank or 'NA' for the first entry. Updates can include additions or revisions of the entry for any reason. For example, a wastewater measure was repeated later with an improved method. You can revise the entry by updating the value and then adding the date the new measure was performed to 'lastEdited'. To ensure data provenance, the best practice in this example is to generate a new entry with the same measureID as the original measureID. The original and new measures are kept in the database with a date in the 'lastEdited' field for the new entry but not the original one. Some databases may choose a delete-and-replace approach where the original entry is deleted and replaced by a new entry. In this approach, the 'lastEdited' field indicates the delete and replace occurred.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,header,optional,14,header,optional,8,header,optional,28,header,optional,6,header,optional,13,header,optional,19,header,optional,21,header,optional,9,header,optional,9,header,optional,9,header,optional,13,header,optional,13,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,7,header,optional,5,header,optional,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,datetime,NA,NA,0,30
lastName,Last name of contact,attributes,Specifies the last name of a given contact.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lastUpdated,Last updated version,partSupport,The version in which the part was last updated.,Any change to the part of list will result in a change in the lastUpdated field to the dictionary version where the update occurred. ,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,11,header,mandatory,8,header,mandatory,23,header,mandatory,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
latExp,LaTeX expression,partSupport,"LaTeX expression used to generate formulas, symbols, etc. Mainly relevant for units. ",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,14,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,20
lBC,Low breadth of coverage,qualityIndicators,The percentage of the genome covered by reads (the breadth) is low.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lcsd,Laboratory control sample duplicate,categories,"Known amounts of an analyte or representative compounds are added to a second ""clean"" matrix (lab water or clean sand) in laboratory. Duplicate of LCS",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lDC,Low depth of coverage,qualityIndicators,"Poor coverage, specifically an insufficient number of reads or too many sequencing reads that are mapped incorrectly.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
leaked,Leaked sample,qualityIndicators,"Sample leaked, some volume and material was lost.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
legionella,Legionella,measurements,Legionella,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,legionellaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
legionellaGrp,Legionella Group,groups,A group of measures/methods related to legionella bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,legionellaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lentiGrp,Lentivirus Group,groups,"A group of measures/methods related to lentiviruses, including viral vectors such as the Puro virus vector.",Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,lentiGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lgpl21,GNU Lesser General Public License v2.1,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the GNU Lesser General Public License v2.1.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/lgpl-2.1/,varchar,NA,NA,0,30
lgpl30,GNU Lesser General Public License v3.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the GNU Lesser General Public License v3.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/lgpl-3.0/,varchar,NA,NA,0,30
li,Link,attributes,Link to an external reference that describes the geometry of the polygon.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Use referenceLink instead.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated and collapsed into the generic part, partID =""refLink""",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
license,License,attributes,The license of a dataset.,"Specify the dataset's license name or provide a description of the license. Individual measures may possess their own licenses, which take precedence over the overall database license.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,licSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #205,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
licSet,Data license set,mmaSets,The set to describe valid categorical values for the licensing fields for measures or datasets.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/appendix/,categorical,NA,NA,0,30
linearAggrSet,Linear scale aggregation set,aggregationSets,The aggregation set that contains all aggregations that exist on the linear scale.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
liq,Liquid fraction,categories,Liquid fraction of a sample.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
liquid,Liquid/Supernatant retained,categories,The liquid or supernatant is retained after solid separation/centrifugation.,NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,NA,NA,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
listeria,Listeria,measurements,Listeria,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,listeriaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
listeriaGrp,Listeria Group,groups,A group of measures/methods related to listeria bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,listeriaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lists,List worksheet,dictionarySupport,Parts lists for template dropdowns and other documentation.,Sheets or tabs for the ODM Excel dictionary include: all ERD tables (look-up tables and data entry tables) and additional supportig tables. ,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,NA,NA
listSet,List set,dictSets,"PartTypes that contain categories, sets, or lists.",Used to generate documentation.,naDomain,naSpecimenSet,airCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
localHA,Access to local ha,attributes,"If this is 'no', the, data will not be available to local health authorities. If missing, data will be available to local health authorities.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, sharing moved to sharing schema",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,1
lod,Limit of detection (LOD),measurements,"Limit of detection, ie. the minimum level of a genetic target.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
lodSewa,Limit of detection (LOD) - sewage,measurements,"Limit of detection, ie. the minimum level of a genetic target, for sewage samples.",NA,bio,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
log10cpG,log10 gene copies per g,units,Unit for log10 copies per gram,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$log10 gc/{g}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
log10cpL,log10 gene copies per L,units,Unit for log10 copies per litre,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$log10 gc/{l}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
log10cpml,log10 gene copies per mL,units,Unit for log10 copies per mililitre,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$log10 gc/{ml}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
log10ugG,log10 micrograms per g,units,Unit for log10 micrograms per gram,NA,allDo,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,standardConc,naNomenclature,NA,$\log10 mu g/{g}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
log10ugL,log10 micrograms per L,units,Unit for log10 micrograms per litre,NA,allDo,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,standardConc,naNomenclature,NA,$\log10 mu g/{l}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
logAggrSet,Logarithmic scale aggregation set,aggregationSets,The aggregation set that contains all aggregations that exist on the logarithmic scale (rather than linear or qualitative).,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lookup,Dictionary tables,classes,Tables to describe and support the ODM dictionary. ,"These tables hold information on sets, all parts, and support multiple languages and translations. The tables are updated by the ODM development team when a new ODM version is created.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,lookup,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
loq,Limit of quantification (LOQ),measurements,Loq,Limit of quantification (LOQ) for this method if one exists.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
low,Low severity,categories,A marker for low severity,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,Input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lowerCI95,Lower limit of a 95% confidence interval,aggregations,Specifies the the lower limit of a 95% confidence interval.,"Should typically be linked to an upper limit, and some indication of data spread (ie. standard deviation), and a mean/median measure.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
lowVol,Low-volume sample,qualityIndicators,"Sample is low-volume, but was run regardless. ",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lppa24s,Omicron Variant LPPA24S mutation,measurements,Omicron Variant LPPA24S mutation,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
lppl13c,LaTeX Project Public License v1.3c,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the LaTeX Project Public License v1.3c.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/lppl-1.3c/,varchar,NA,NA,0,30
ltcf,Long-term care facility,categories,A residential healthcare facility that provides 24-medical care. These are also called skilled nursing facilities.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ltcfAl,Long-term care - assisted living or retirement home,categories,A residential facility that provides assistance with daily care but generally does not provide skilled nursing care. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ltcfO,Other long-term care,categories,"Other residential facilities that provide daily and/or medical care, but are not defined as nursing home/skilled nursing facilities or assisted living facilities. ",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ltDpcr,Life technologies digital PCR,categories,Describes a PCR analysis done using Life Technologies' digital PCR technology.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
luminWWExtract,luminultra wastewater extraction kit,categories,luminultra wastewater extraction kit,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
lysi,Lysis buffer,categories,Lysis buffer.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
m3D,Cubic metres per day,units,Cubic metres per day.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
m3H,Cubic metres per hour,units,Cubic metres per hour.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
m3S,Cubic metres per second,units,Cubic metre per second.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
malariaGrp,Plasmodium or Malaria Group,groups,A group of measures/methods related to plasmodium parasites or malaria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,malariaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
manComp,Manual Composite Sample,categories,Specifies a composite sample where the sub-samples were collected manually.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
manufacturer,Manufacturer,attributes,Manufacturer of an instrument.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
mateLay,Mate pair layout,categories,Specifies the mate pair layout for a sequencing method.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
maxLength,Maximum length,partSupport,The maximum length of the value of a part or measure. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,96,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,NA,NA,0,30
maxVal,Maximum value,aggregations,Highest value in a range of values for a measure.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
maxValue,Maximum value part support,partSupport,The maximum value of a part. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mcr11,MCR-1.1 Colistin-resistence gene target,measurements,The MCR-1.1 colistin anti-microbial resistance gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,colAMRGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.mediterranee-infection.com/acces-ressources/base-de-donnees/arg-annot-2/,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
me,Arithmetic mean,aggregations,Arithmetic mean.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
measGrp,Measurement group,groups,A group of measures that cannot be otherwise categorized.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measles,Measles,measurements,Measles,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,measlesGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
measlesGrp,Measles Group,groups,A group of measures/methods related to the measles virus.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,measlesGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measOth,Other Measure,measurements,"Other measure, not otherwise specified in measures.",Add description to categoryOther.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
measQualitySet,Measures quality set,qualityIndSets,"A quality set for any measure, includes all the quality flag options for any measure.","Used as an ""any quality set"" for measures, but excludes the sample quality flags to avoid confusion and data entry errors.",naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,measQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
measure,Measure,attributes,"A measurement or observation of any substance including a biological, physical or chemical substance."," An measurement is recorded from a specimen (i.e. a site, sample, person or population). Measures are organized into groups and classes (sub-groups). ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,fK,mandatoryIf,3,NA,NA,NA,fK,mandatory,17,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
measureInput,Measure input (wide table),attributes,The partID for the measure being used in a wide name.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,21,NA,varchar,NA,NA,0,30
measureLic,Measure license,attributes,Specifies the access and use licensing for a given single measurement.,Populated by partID = licenseID,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,licSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,23,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
measurements,Measures,partType,"The attribute to describe a part type of measures. All measures have `partType` = ""measure"". ",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
measureName,Measure name (wide table),attributes,The measure referenced for the wide name.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,20,NA,varchar,NA,NA,0,30
measureRepID,Report ID,attributes,Unique identifier for a measurement.,Report IDs cannot be repeated.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,pK,mandatory,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,FK,mandatoryIf,2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measures,Measure report table,tables,The table that contains information and details about a given measure,adapt from verson 1 documentation,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,results,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,combined all measures tables into a single table,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,31,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measureSetRepID,Measure set report set ID,attributes,Unique identifier that links together a group of related measures.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,8,pK,mandatory,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,FK,mandatoryIf,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measureSets,Measure set report table,tables,The table that identifies sets of measures.,"Examples of measure sets include a set of replicates, dilutions (used to generate a Ct curve) or varients that are identified in a single sample.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,results,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,34,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measureSetsOrder,Measure sets table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in a Measure Sets table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,35,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
measureSetsRequired,Measure Set table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Measure Sets table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,36,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
measuresOrder,Measures table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in a Measures table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,33,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
measuresRequired,Measures table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Measures table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,32,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
med,Median,aggregations,Median.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
memMgCl3,membrane filtration with addition of mgcl3,categories,membrane filtration with addition of mgcl3,NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
menr,Normalized arithmetic mean,aggregations,"Arithmetic mean, normalized.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
meOthDe,Other Measure Description,measurements,Description of other measure (measOtherDesc).,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,60
mes,Measures Part-type Shorthand,shortName,"The abbreviated short name used to reference the The attribute to describe a part type of measures. All measures have `partType` = ""measure"". ",part type,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
met,Methods part-type Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the Procedures or steps for collecting samples or performing measures.,part type,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
metaboliteGrp,Metabolite Group,groups,A group of measures/methods related to metabolites.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,metaboliteGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
method,Method,attributes,A procedure for collecting a sample or performing a measure.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,fK,mandatoryIf,2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,10
methodConc,Concentration method,methods,Description of the method to concentrate a wastewater sample.,Description of the method used to concentrate the sample,allDo,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,methodConcSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,100
methodConcSet,Concentration method set,mmaSets,A set a concentration methods.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
methodInput,Method input (wide table),attributes,The partID for the method being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,23,NA,varchar,NA,NA,0,30
methodName,Method name (wide table),attributes,The method referenced for the wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,22,NA,varchar,NA,NA,0,30
methods,Methods,partType,Procedures or steps for collecting samples or performing measures.,"For example, `methodExtract` is a method that describes the how a sample was extracted.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
mfAcidmgcl2,Membrane filtration with acidification and mgcl2,categories,Membrane filtration with acidification and mgcl2,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfAcidmgcl2SS,"Membrane filtration with acidification and mgcl2, membrane recombined with separated solids",categories,"Membrane filtration with acidification and mgcl2, membrane recombined with separated solids",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfMgcl2,Membrane filtration with addition of mgcl2,categories,Membrane filtration with addition of mgcl2,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfMgcl2SS,Membrane filtration with mgcl2 and separated solids,categories,"Membrane filtration with addition of mgcl2, membrane recombined with separated solids",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfNoAmend,Membrane filtration with no amendment,categories,Membrane filtration with no amendment,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfNoAmendSS,"Membrane filtration with no amendment, membrane recombined with separated solids",categories,"Membrane filtration with no amendment, membrane recombined with separated solids",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfSampleAcid,Membrane filtration with sample acidification,categories,Membrane filtration with sample acidification,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mfSampleAcidSS,"Membrane filtration with sample acidification, membrane recombined with separated solids",categories,"Membrane filtration with sample acidification, membrane recombined with separated solids",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mgd,Millions of gallons per day (MG/D),units,"A unit for measuring of design capacity for wastewater treatment plants, represented as millions of gallons per day. Also can be used to measure flow.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #123,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
mGenitalus,Mycoplasma genitalus,measurements,Mycoplasma genitalus,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mycoplasmaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mgL,Milligrams per litre,units,Milligrams per litre.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
mhv,Murine Hepatitis Virus,measurements,A measure for amount of murine hepatitis viurs.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,hepGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mhvSpike,murine hepatitis virus (MHV) spike target,categories,Murine hepatitis virus is used as the recovery efficiency control target.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mI,Multiple issues,qualityIndicators,Multiple issues have arisen in the sequencing process. ,"When using the 'multiple issues' quality flag, please specify the issues and details in the notes section.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mid,Mid-level severity,categories,"A marker for med-level severity, where there are some concerns.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,Input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
minLength,Minimum length,partSupport,The maximum value of measure.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,95,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,NA,NA,0,30
minutes,Minutes,units,A unit for indicating a length of time in minutes.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,time,naNomenclature,NA,$minutes$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
minVal,Minimum value,aggregations,Lowest value in a range of values for a measure.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
minValue,Minimum value part support,partSupport,The minimum value of part.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,93,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
miscAttr,Miscellaneous attribute group,groups,A group of miscellaneous measurement-like attributes.,"Examples of these would be longitude and latitude, or EPSG coordinates.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
miscMeas,Miscellaneous measure group,groups,A group of measures that cannot be otherwise categorized.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
missingness,Missingness,partType,The part type for missingness values.,Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
missingnessSet,Missingness Set,attributes,"Missingness sets for measures, methods or attributes. ","Inputted data into an ODM field may have missing data. The missingness set lists valid missing categories for the measure, method, or attribute.",naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,20,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
missingnessSets,Missingness sets,partType,Set of missingness values.,"Examples of missingness sets may include NR or NA esclusive sets, or general all-purpose sets.",naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
mit,MIT,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the MIT license.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/mit/,varchar,NA,NA,0,30
mit0,MIT No Attribution,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the MIT no attribution license.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/mit-0/,varchar,NA,NA,0,30
mix,Mixed/homogenized sample,categories,Mixed or homogenized sample or fraction analyzed.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ml,Millilitres,units,Millilitres of volume,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,NA,NA,0,30
mld,Megalitres per day (ML/d),units,Megalitres per day.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
mlod,Method Limit of Detection (LOD),measurements,"The minimum level of a target necessary for its consistent detection considering all sample processing steps as in the definition of
SLOD), but considering biases attributable to method losses. The MLOD is experimentally determined using a rigorous and iterative testing approach and it is sensitive to the recovery surrogate used and the sample matrix encountered.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mm,Millimetres,units,Unit part for the SI unit of millimetres.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
mmaSet,"Measure, Method, or Attribute Set Header",attributes,"The set for a measure, method, or attribute. Only applicable for categorical fields, and the categories that populate them.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,15,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,12
mmaSets,"Measure, method, or attribute sets",partType,"A set of categories. For example, site type has a list of different sites, such as a wastewater treatment plant, a septic tank, or a pumping station.",Only used for the dictionary entries of parts.,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
model,Model,attributes,Model number or version of the instrument.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
monarchRNA,monarch total RNA miniprep kit (new england biolabs) + onestep PCR inhibitor removal kit (zymo),categories,monarch total RNA miniprep kit (new england biolabs) + onestep PCR inhibitor removal kit (zymo),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
months,Months,units,A unit for indicating a length of time in months.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,time,naNomenclature,NA,$months$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
moorSw,Moore swab passive sample,categories,Moore swab passive sample.,Use collectionPeriod to describe how many hours the Moore swab was used to collect the sample,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mpl20,Mozilla Public License 2.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Mozilla Public License 2.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/mpl-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
mpox,Mpox,measurements,"The virus known as Mpox, previously also known as Monkey Pox.",NA,bio,poSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mpoxGrp,MPox Group,groups,"A group of measures/methods related to Mpox (formerly ""Monkey Pox"").",Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mpvGrp,Metapneumovirus Group,groups,A group of measures/methods related to metapneumoviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpvGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mpoxCldIGrp,MPox Clade I Group,groups,"A group of measures/methods related to Mpox Clade I (formerly ""Monkey Pox"").",Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxCldIGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mpoxCldIIGrp,MPox Clade II Group,groups,"A group of measures/methods related to Mpox Clade II (formerly ""Monkey Pox"").",Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mpoxCldIIGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mr,Measure report table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the The table that contains information and details about a given measure,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mrsa,Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA),measurements,Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,staphGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mps,Metres per second,units,metres per second.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
ms,Measure set report table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the The table that identifies sets of measures.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ms2Col,ms2 coliphage,measurements,Measure of the amount of ms2 coliphage.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ms2ColMat,ms2 coliphage spike target,categories,ms2 coliphage is used as the recovery efficiency control target.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
msd,Matrix spike duplicate,categories,A known amounts of an analyte or representative compounds are added in the laboratory to a second aliquot of the sample used for matrix spike.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mspl,Microsoft Public License,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Microsoft Public License.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/ms-pl/,varchar,NA,NA,0,30
mspsDep,Moore swab passive sample depreciated,categories,Moore swab passive sample.,"Deprecated in version 2, please do not use.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"added in V2.0, depreciated after",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
mSwrPpl,Major sewer pipeline,categories,Major sewer pipeline,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mTuberculosis,Mycobacterium tuberculosis,measurements,Mycobacterium tuberculosis,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,tuberculosisGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mu,Mu,measurements,B.1.621,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
muCo,murine coronavirus,measurements,Measure of the amount of murine coronavirus.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,betaCoronaGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
muCoMat,murine coronavirus spike target,categories,Murine coronavirus is used as the recovery efficiency control target.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mul,Multiple fraction,categories,Multiple fractions were analyzed separately and aggregated together post-analysis.,This fractionID is intended for use for archival data and should not be used for newly added new moving forward (2022). Please also specify in the notes section which fractions were used for the multiple fractions (ex. solid and liquid) to avoid loss of information.,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mulanPSL20,"Mulan Permissive Software License, Version 2",categories,The licensing for the measure or data set is managed under version 2 of the Mulan Permissive Software License.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/mulanpsl-2.0/,varchar,NA,NA,0,30
multiple,Multiple Purpose,categories,"A measure or sample taken for multiple purposes, not easily captured by the other purpose categories.",Useful for parent samples where various subsamples will have different purposes/,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mumps,Mumps,measurements,Mumps,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mumpsGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
mumpsGrp,Mumps Group,groups,A group of measures/methods related to the mumps virus.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mumpsGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
municipalLevel,Municipalities or communes,attributes,Municipalities or communes,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,depreciated,2.0.0,2.1.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
municp,Municipality,categories,"A complete municipality, this specifies an entire metropolitan area, either a city, town, etc.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mutation,Mutations class,classes,Measures and methods related to mutations.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,measQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mutationPanel,Mutation panels class,classes,Measures and methods related to a panel or list of more than one mutation from the same sequence read.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,mutationPanel,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,seqQualitySet,NA,development,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
mycoplasmaGrp,Mycoplasma Group,groups,A group of measures/methods related to mycoplasma bacteria.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,mycoplasmaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
n,N sars-cov-2 gene target,measurements,N sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
n1n2,Combined N1 and N2 sars-cov-2 gene target,measurements,Combined N1 and N2 sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
n1neur,Influenza A N1 neuraminidase gene,measurements,"Measure of the N1 neuraminidase gene from the Highly Pathogenic Avian Influenza Virus (HPAIV), the H5N1 Influenza A Virus (IAV) subtype.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,fluAGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
n211i,Omicron Variant n211i mutation,measurements,Omicron Variant n211i mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
n679k,Omicron Variant n679k mutation,measurements,Omicron Variant n679k mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
n856k,Omicron Variant n856k mutation,measurements,Omicron Variant n856k mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
n969k,Omicron Variant n969k mutation,measurements,Omicron Variant n969k mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
NA,Not applicable,missingness,The field for which the expected value is not a property of the described object.,Missing value indicator for missing data with no explanation.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naAggr,Aggregation not applicable,aggregations,Not applicable for aggregations.,Used for parts for which an aggregation value is not applicable or appropriate.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naAggrScale,Aggregation scale not applicable,aggregationScales,Not application for aggregation sets.,Used for parts for which an aggregation scale value is not applicable or appropriate.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naAggrSet,Aggregation set not applicable,aggregationSets,Not application for aggregation sets.,Used for parts for which an aggregation set value is not applicable or appropriate.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naClass,Class not applicable,classes,Class is not applicable.,Use this for all parts that don't have classes (most non-measure or method parts),naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naCompartment,Compartment not applicable,compartments,Compartment not applicable.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,15
naCompartmentSet,Compartment set not applicable,compartmentSets,Compartment not applicable.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,13
naDomain,Domain not applicable,domains,Not applicable. ,Use 'not applicable' when there is no domain for the part,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naGroup,Group not applicable,groups,Used when there is no group; ie. group is not applicable.,Use 'not applicable' when there is no group for the part,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
name,Name,attributes,"Name of a domain, specimen, group, class, attribute, unit, nomeclature or other entity.","Name of any entity. Use a prefix to distinguish names from different report tables. See fully specified name (FSN) list. i.e. Si-name = Site name, Po-name = Polygon name, Or-name = Organization name, Me-name = Method-name. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,3,header,recommended,4,header,recommended,10,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,recommended,2,header,recommended,3,header,recommended,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nameEngl,English name for countries,attributes,English-language name of a given country.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
nameOfficial,Official state name,attributes,Official english-language name of a given state.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
nan,Not a number,missingness,"The outcome of a measurement is not a valid number (plus or minus infinity, error, ...)",Missing values indicator for when a numeric value is expected but not given.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naNomenclature,Nomenclature not applicable,nomenclatures,Not applicable. ,Use 'not applicable' when there is no nomenclature for the part,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naSpecimen,Specimen not applicable,specimens,Non applicable specimen.,Use 'not applicable' when there is no specimen/set for the part,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naSpecimenSet,Specimen set not applicable,specimenSets,A specimen set for when specimen/specimen set is not applicable.,Use 'not applicable' when there is no specimen/set for the part,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
natName,Native Name,attributes,"The native name of the language, i.e. what the language is called by its speakers.",Part of the metedata for a languageID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
naUnit,Unit not applicable,units,Not appliable for units.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
naUnitSet,Unit set not applicable,unitSets,Not applicable for unit sets.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ncbi,National Center for Biotechnology Information,attributes,NCBI header,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ncbiNotes,NCBI - notes,attributes,NCBI notes,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ncsa,University of Illinois/NCSA Open Source License,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the University of Illinois/NCSA Open Source License.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/ncsa/,varchar,NA,NA,0,30
neigh,Neighbourhood,categories,"A municipal neighbourhood, this specifies a sub-section of a larger municipality.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
neighborLevel,Local administrative units or neighborhoods,attributes,Local administrative units or neighborhoods,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,depreciated,2.0.0,2.1.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
newVax,Population of newly vaccinated persons,units,Population of newly vaccinated persons,A unit used for for specifying a population-wide vaccination level measure.,naDomain,poSpecimenSet,humanCompartmentSet,popGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
nextclade,NextClade nomenclature,nomenclatures,Specifies variant or genetic nomenclature as set out by NextClade.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,nextclade,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ngmn,Normalized geometric mean,aggregations,"Geometric mean, normalized.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
nGonorrhoeae,Neisseria gonorrhoeae,measurements,Neisseria gonorrhoeae,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,gonococcusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
nH4N,Ammonium Nitrogen,measurements,"Ammonium nitrogen concentration, as N.",NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,waterQualityGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
niid19,niid_2019-ncov_n sars-cov-2 gene target,measurements,niid_2019-ncov_n sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
nM,Nano-molar,units,the unit of nanomolar.,NA,che,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,standardConc,naNomenclature,NA,$nM$,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noConcern,No quality concerns,qualityIndicators,A flag to indicate there is are no quality concern about the measure or sample.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noLabel,Sample not labelled,qualityIndicators,Sample had no label,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noliquid,"No liquid concentration, liquid recombined with separated solids",categories,"No liquid concentration, liquid recombined with separated solids",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nomenclature,Nomenclature,attributes,"A classification system to report the measure class. Only applicable to variants, mutations, and diseases.","Currently only used for class = variant, mutation, or disease. Valid options are currently restricted to 'NextClade', 'Pangolin', 'WHO', or 'ICD'.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,21,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,12,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
nomenclatures,Nomenclatures,partType,A classification system to report the measure class. ,See partID = nomenclatureID.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
noRain,No rain,categories,"Qualitative category for the weather measure, specifying no rainfall for a given day.",NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,siteFeat,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
norman,NORMAN,attributes,NORMAN header,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
normanNote,NORMAN - notes,attributes,Norman notes,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noro,Norovirus,measurements,Norovirus.,NA,bio,poSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,noroGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noroG1,Norovirus G1,measurements,Norovirus genogroup 1,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,noroGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
noroG2,Norovirus G2,measurements,Norovirus genogroup 2,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,noroGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
noroGIGrp,Norovirus GI Group,groups,A group of measures/methods related to norovirus GI.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,noroGIGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noroGIIGrp,Norovirus GII Group,groups,A group of measures/methods related to norovirus GII.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,noroGIIGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noroGrp,Norovirus Group,groups,A group of measures/methods related to noroviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,noroGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
noSep,No Seperation or Concentration,categories,"Denoted that a sample did not undergo a solids separation protocol, or did not undergo a sample concentration protocol.",NA,phy,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
notes,Notes,attributes,A note used to describe details that are not captured in other attrbitutes,There is no recommended structure of a note. Use notes as needed.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,header,optional,15,header,optional,9,header,optional,29,header,optional,7,header,optional,14,header,optional,20,header,optional,22,header,optional,10,header,optional,10,header,optional,10,header,optional,14,header,optional,14,header,optional,13,header,optional,10,NA,NA,NA,header,optional,11,header,optional,8,header,optional,6,header,optional,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,200
noTime,Sample missing time stamp,qualityIndicators,Sample is missing the autosampler time; incomplete metadata on collection.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nr,Not reported,missingness,"A value could have been recorded, however, it was not.",Missing value indicator for data that is absent because it was not reported.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nrNAMissingnessSet,"Not reported, Not applicable missing set",missingnessSets,"Not reported, Not applicable missing set.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nSarbec,Sarbecovirus-specific N sars-cov-2 gene target,measurements,Sarbecovirus-specific N sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
ntcAmp,NTC Amplification Detected,qualityIndicators,"Quality flag for when the non-template control (NTC) still sees amplification - ie. The NTCs in qPCR show a Ct value less than 40, or NTCs in a ddPCR have 3 or more positive droplets.",NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ntcFlag,Control-plate Flag - NTCs,measurements,TBD,TBD,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,development,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ntu,Nephelometric turbidity unit,units,"Nephelometric Turbidity Units, a unit used in the measurement of turbidity (see ""turbidity"" under measureIDs).",Nephelometric turbidity units (NTU) are based on white light (400–680nm) and 90° incident angle.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,logAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #122,input,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,https://www.sciencedirect.com/topics/engineering/nephelometric-turbidity-unit,float,0,NA,NA,NA
nucAuto,Nuclisens automated magnetic bead extraction kit,categories,Nucleic acid extraction performed using the nuclisens automated magnetic bead extraction kit.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nucKingfish,nucleomag (ref. 744220.4) using kingfisher automated instrument,categories,nucleomag (ref. 744220.4) using kingfisher automated instrument,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nucManu,Nuclisens manual magnetic bead extraction kit,categories,Nucleic acid extraction performed using the nuclisens manual magnetic bead extraction kit.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
null,Null,missingness,A logical representation of a statement that is neither TRUE nor FALSE.,Missing value indicator when the value is neither TRUE nor FALSE.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
numCode,ISO 3166-1 numeric country code,attributes,"The ISO 3166-1 numeric code, a three-digit country code which is identical to that developed and maintained by the United Nations Statistics Division, with the advantage of script (writing system) independence, and hence useful for people or systems using non-Latin scripts.","Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,3,3
numNTC,Number of NTCs per Run,measurements,The number of no-template controls included in each PCR instrument run.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
nwss,National Wastewater Surveillance System,attributes,NWSS header,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nwssNotes,NWSS - notes,attributes,NWSS notes,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nwssProcess,NWSS - process,attributes,NWSS process,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
nww,Water,categories,"Non-wastewater, coming from any kind of water body",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
oc43,coronavirus OC43,measurements,Measure of the amount of coronavirus OC43.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
oc43Mat,oc43 spike target,categories,Human coronavirus OC43 is used as the recovery efficiency control target.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ocean,"Ocean, natural water body",categories,"Ocean, natural water body",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
oColDep,Other Collection depreciated,categories,Other type of collection method. Add description to collectionOther.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Specify in type, or contact the PHES-ODM research team to add your specific item via a github issue (https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues), or at [email protected]",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
ofl11,SIL Open Font License 1.1,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the SIL Open Font License 1.1.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/ofl-1.1/,varchar,NA,NA,0,30
ola,Lab Analysis,categories,Offline laboratory analysis.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
omicr1,Omicron BA.1,measurements,Omicron B.1.1.529,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
omicr2,Omicron BA.2,measurements,Omicron BA.2,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
omicr275,Omicron BA.2.75,measurements,Omicron BA.2.75,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
omicr4,Omicron BA.4,measurements,Omicron BA.4,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
omicr5,Omicron BA.5,measurements,Omicron BA.5,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,who,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
omicronGrp,SARS-CoV-2 Omicron Variant Group,groups,A group of measures/methods related to the SARS-CoV-2 Omicron Variant.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,naClass,naNomenclature,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C169076,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
onsDate,Onset date,categories,"Earliest that symptoms were reported for this case. This data is often not known and reported. In lieu, episode is used.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,added in V2.0; depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
onse,Online Sensor,categories,Online sensor,An online sensor,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ontologyRef,Ontology reference,partSupport,Ontology reference for a part.,"This field contains a link to an existing ontology reference for the part. ODM content spans several existing ontologies. ODM does not strive to generate a new ontology, rather ODM seeks to harmonize and extend dictionaries for application in environmental and public health surveillance. ",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,13,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,200
oor,Value out of range,qualityIndicators,Value is outside of the allowable range for quality control.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
open,Open license not otherwise described,categories,The licensing for the measure or data set is managed under an open license not otherwise described.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
ophos,Orthophosphates,measurements,Ortho-phosphate concentration.,NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,waterQualityGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
or,Organization table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the The table that contains information about a laboratory.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
orb,Other residential building,categories,Individual residential buildings or institutions not captured in other categories,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
orBoo,OR Boolean aggregation,aggregations,"""OR"" aggreation.","If any value in the aggregation is ""TRUE"" then the OR aggregation is also ""TRUE"". If all values in the aggregation is ""FALSE"" then the OR aggregation is also ""FALSE"".",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
orf1a,ORF1a sars-cov-2 gene target,measurements,ORF1a sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
orf1ab,ORF1ab sars-cov-2 gene target,measurements,ORF1ab sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
orf1b,ORF1b sars-cov-2 gene target,measurements,ORF1b sars-cov-2 gene target,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
organism,Organism,classes,Organism class,"Identify class = `organism` for when a part identifies an organism and partType = `groups`. Indivdual measures should be recorded with a class for the specific measure type. i.e. allele, variant, mutation, etc. ",bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,seqQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
organizationID,Organization ID,attributes,A unique identifier for the organization to which the reporter is affiliated.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,added in V2.0.0,fK,optional,8,NA,NA,NA,header,optional,25,fK,optional,4,NA,NA,NA,header,optional,8,header,optional,3,NA,NA,NA,fK,mandatory,3,pK,mandatory,1,fK,optional,7,header,optional,11,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,100
organizations,Organization table,tables,The table that contains information about a laboratory.,adapt from verson 1 documentation,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,programDescr,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,52,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
organizationsOrder,Organizations table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in a Organizations table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,54,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
organizationsRequired,Organziation table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Organizations table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,53,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
orgLevel,Organization level,attributes,The geographic level of an organization.,There are six levels based on International Standard Classification of Administrative Units (ISCU). ,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,orgLevelSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,recommended,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
orgLevelSet,Organization level set,mmaSets,Categories of organization levels.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,10
orgSector,Organization sector,attributes,The sector of an organization,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,orgSectorSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,recommended,8,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
orgSectorSet,Organization sector set,mmaSets,Cateogries of organization sectors.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,10
orgType,Organization Type,attributes,Specifies the type or purpose of a given organization. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,orgTypeSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,nrNAMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,recommended,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
orgTypeSet,Organization type set,mmaSets,The set for storing organization types.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,10
origin,Sample origin,attributes,An attribute of a sample specifying the origin.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; GitHub issue #94,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,9,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
originSet,Sample Origin set,mmaSets,The set for storing the valid categorical values of sample origin.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
orthoGrp,Orthopox Virus Group,groups,A group of measures/methods related to orthopox viruses (excluding variolla viruses).,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,orthoGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
osl30,Open Software License 3.0,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the Open Software License 3.0.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/osl-3.0/,varchar,NA,NA,0,30
otco,Other Collection depreciated,categories,Other type of collection method. Add description to collectionOther.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Specify in type, or contact the PHES-ODM research team to add your specific item via a github issue (https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues), or at [email protected]",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
othAgg,Other aggregation scale,aggregationScales,"Specifies an aggregation scale that can't be described as either ""qualitative"" or ""quantitative"".",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
other,Other,categories,Other,"Other category. A categorical response for several variables in version 1. Also accompanied by a free text field. Depreciated in version 2, with common text fields added as new categories in version 2.0.0",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,2.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
otherAggrSet,Other aggregation set,aggregationSets,Aggregation set used for unitless measures.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
otherDep,Other aggregation depricated,aggregations,Other aggregation method. Add description to aggregationOther,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Specify in type, or contact the PHES-ODM research team to add your specific item via a github issue (https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues), or at [email protected]",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
otherProvDep,Access to other prov depricated,attributes,"If this is 'no', this data will not be available to other data providers not listed before. If missing, data will be available to other data providers not listed before",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, sharing moved to sharing schema",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,1
otherReportTableSet,Other report table set,dictSets,Additional tables that form the full data model.,NA,naDomain,saSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
otherV,Variants Other,measurements,Used for reporting variants detected for which a specific measureID doesn't already exist. The ODM team will periodically migrate collected responses in this category into set measureIDs.,"Please write in an official name for the new variant that was detected, and specify which nomenclature you're using with the nomenclatureID.",bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,sarsCov2,variant,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
otsisaDep,Other Site - sample depreciated ,categories,Other type of site. Add description to typeOther.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Specify in type, or contact the PHES-ODM research team to add your specific item via a github issue (https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues), or at [email protected]",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
otsisiDep,Other Site - Site depreciated,categories,Other site type. Add description to typeOther,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
otunDep,Other Unit depricated,units,Other measurement of viral copies or wastewater treatment plant parameter. Add description to UnitOther.,"Deprecated as of version 2, please avoid use. Specify in type, or contact the PHES-ODM research team to add your specific item via a github issue (https://github.com/Big-Life-Lab/PHES-ODM/issues), or at [email protected]",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"Depreciated in version 2 with all ""other"" fields",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,NA,NA,0,30
out,Value is an outlier,qualityIndicators,Value is an outlier and may be of questionable quality.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
outb,Outbreak,measurements,"Measure to indicate outbreak status. Given that when outbreaks occur, full data on case counts may not be available or completely accurate, using this measure indicates that case counts may be approximate.",The datetime for the measure helps indicate that start and end periods for an outbreak.,bio,poSpecimenSet,humanCompartmentSet,miscMeas,outbreak,naNomenclature,NA,NA,outbreakSet,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0; github issue #203,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
outbEnd,Outbreak End,categories,Indicates an outbreak has ended.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
outbOngoing,Outbreak - on-going,categories,Indicates an outbreak is on-going.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
outbreak,Outbreak class,classes,Measures and methods relating to public health outbreaks.,NA,bio,poSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,outbreak,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
outbreakSet,Outbreak set,mmaSets,set for the valid values of the outbreak measure.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,outbreakSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
outbStart,Outbreak start,categories,Indicates an outbreak began.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
p100l,Delta Variant p100l mutation,measurements,Delta Variant p100l mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,deltaGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
p13L,Omicron Variant p13l mutation,measurements,Omicron Variant p13l mutation,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
p2046l,Delta Variant p2046l mutation,measurements,Delta Variant p2046l mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,deltaGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
p2287s,Delta Variant p2287s mutation,measurements,Delta Variant p2287s mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,deltaGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
p3395h,Omicron Variant p3395h mutation,measurements,Omicron Variant p3395h mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,omicronGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
p681r,Delta Variant p681r,measurements,Delta Variant p681r mutation & gene target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,deltaGrp,mutation,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
pAct,polymerase activation,categories,Describes the polymerase activation cycle in a PCR process.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pa,Parts Look-up table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the Look up table containing all parts in of the data model.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pairLay,Paired Layout,categories,Specifies the paired layout for a sequencing method,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pangolin,Pangolin nomenclature,nomenclatures,Specifies variant or genetic nomenclature as set out by the Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (Pangolin).,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,pangolin,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
papilomavirusGrp,Papilomavirus Group,groups,A group of measures/methods related to papilomaviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,papilomavirusGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
para,Paraxanthine (PARA),measurements,"A metabolite of the common central nervous system stimulant caffeine, measred levels of paraxanthine have been found to be less affected by the genetic heterogeneity and population structure than caffeine is, and it may serve as a useful population biomarker in wastewater.",NA,che,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
parafluGrp,Parainfluenza Group,groups,A group of measures/methods related to parainfluenza viruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,parafluGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
parapoxSpike,Parapoxvirus Orf Virus Spike Target,categories,parapoxvirus // Orf virus is used as the recovery efficiency control target.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
parDatasetID,Parent dataset ID,attributes,The datasetID that is a parent to another datasetID. ,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
parent,Parent sample ID,attributes,If this sample has been pooled into one big sample for analysis this indicates the sample of the larger pooled sample.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.1.0,2.0.0,Replaced in V2 with approach to describe sample relationships that allows greater flexibility than soley parents.,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
parSiteID,Parent Site ID,attributes,The siteID that is a parent to another siteID; usually the sub-site will be contained in the parentSite.,"An example would be surface testing in a LTC facility. The LTC facility would be the parentSiteID, and the various rooms/surfaces would be the sub-sites, or child-sites.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
partDesc,Part description,partSupport,The description of the part.,"Provides description of the part, used for tranlsation.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,5,header,mandatory,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
partID,Part identifier,partSupport,The unique identify of any entity within the dictionary.,"Every entity in the ODM has a partID. The partID must be unique with no duplcates. partIDs are short. partIDs that are constructed by different part attributes can be up 28 characters (check max), but each part attibute should be 1 to 5 characters. partIDs are machine readible, but a knowledgable user can understand what they represent. partID are used, for example, as a header in an Excel input table. Numbers are allowed but there no other special characters other than `_`. `_` is a reserved character that is used to generate a partID using a compoent or table attributes. A partID for a subComponent is automatically generated using attributes of a component. For example, the partID for the compoent `SARS-CoV-2` is `covid`. `Covid` can have many subComponents including different groups (Covid-19-al, Covid-19-va, ovid-pr (allele, variant or protein) or units and aggregatrions (i.e. covid-al-N1-mean-cpl representing ovid allele N1, mean observation of viral copies per litre of effluent). A similar approach to naming subComponent is use for naming parts in a reprotTable.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatory,3,pK,mandatory,1,fK,mandatory,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,28
partInstr,Part instruction,partSupport,Additional notes and instructions on how a part is used and/or defined.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,6,header,optional,6,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,200
parts,Parts Look-up table,tables,Look up table containing all parts in of the data model.,"Contains all parts, including self-referential parts.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,lookup,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,65,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
partsOrder,Parts table column order,tableSupport,Order of headers in the Parts table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,67,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
partsRequired,Parts table required headers,tableSupport,Required headers in the Parts table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,69,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
partType,Part types,partType,Part types describe the purpose or use of the part. ,"Enivornment data has three main part types: measure (i.e. covN1 viral measures, wasteawater flow rate, temperature), method (e.g. how the measure was taken), and attribute (such as a site name). See description of each of the part types within categorySetID = partTypeCatSets.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,15
partTypeInput,Part type input (wide table),attributes,The partID for the part type being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,mandatoryIf,13,NA,varchar,NA,NA,0,30
partTypeName,Part type name (wide table),attributes,The part type being used in a wide name.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatoryIf,12,NA,varchar,NA,NA,0,30
passiveGen,Passive Sample - General,categories,Used to specify a passive sampling method not otherwise specified was used to collect the sample.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pasteur,Pasteurized sample,methods,Binary indicator for whether a sample was pasteurized as part of its processing.,NA,bio,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,unitlessUnitSet,qualAggScale,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,30
pceDep,Primary Clarifier Effluent depreciated,categories,Effluent obtained after primary clarifiers.,"Deprecated in version 2, please do not use. Duplicate of the sampleMat categories - refer to those.",naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, site material like this is now captured in the sample table",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
pCode,Postal or Zip Code,attributes,"The zip code or postal code for a given address, specifying a specifc geographic area.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,7,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pcr,qPCR Class,classes,Measures and methods relating to qPCR.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,measQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pcrAct,PCR Action/Activity,methods,Describes a given PCR cycle for delineating more method information.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,measGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,pcrActSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
pcrActSet,PCR action/activity set,mmaSets,The set capturing containing all of the valid methods for the PCR activity cycles.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,pcrActSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,50
pcrmeth,PCR method,methods,Description of the PCR method.,Description of the PCR method used,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,measGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,pcrSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,description wording,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,100
pcrQualitySet,PCR quality set,qualityIndSets,Quality set for PCR measures.,NA,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
pcrSeq,PCR sequencingsSelection method,methods,"Specifies the PCR selection method for sequencing, ie. that a pre-determined primer was used.",Primer should be specified if this is selected.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
pcrSet,PCR Method set,mmaSets,The set capturing containing all of the valid methods for the PCR methodID.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,pcrSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
pcs,Primary Clarifier Sludge depreciated,categories,Sludge produced by primary clarifiers.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, site material like this is now captured in the sample table",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
pEfflu,Primary clarifier effluent,categories,Effluent obtained after primary clarifiers,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
peg,Polyethyleneglycol (PEG) precipitation,categories,Peg precipitation,NA,che,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
perc,Percent,units,Percentage.,NA,allDo,anySpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$%$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
percRec,Percent recovery,measurements,Percent of the surrogate recovery for a recovery efficiency control assay.,Use this for reporting the results of any recovery control assay.,naDomain,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$%$,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,NA,NA,0,100
ph,pH,measurements,pH measurement,NA,phy,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,waterQualityGrp,pHClass,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,1,14,NA,NA
phac,Access to phac,attributes,"If this is 'no', the data will not be available to employees of the Public Health Agency of Canada - PHAC. If missing, data will be available to employees of the Public Health Agency of Canada - PHAC.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, sharing moved to sharing schema",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,1
phage,PHAGE,attributes,PHAGE header,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
phageGrp,Bacteriophage Group,groups,A group of measures/methods related to bacteriophages.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
phageNotes,PHAGE - notes,attributes,PHAGE notes,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pHClass,pH class,classes,Measures and methods relating to pH.,NA,che,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,pHClass,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
phenCl,Phenol chloroform,categories,Nucleic acid extraction performed using phenol chloroform.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,"added in V2.0.0, added from NWSS",NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
phi6,Pseudomonas virus phi6,measurements,Measure of the amount of pseudomonas virus phi6.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,phageGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
phi6Mat,phi6 spike target,categories,Pseudomonas virus phi6is used as the recovery efficiency control target.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
phone,Country national phone prefix,attributes,International dialing code for the country.,"Preprogrammed into dictionary tables, not editable by users.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.1.0,2.1.0,added in V2.1.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,mandatory,13,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,75
phos,Total phosphorous,measurements,Total phosphorous,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,miscMeas,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
phostot,Total Phosphates,measurements,Total phosphates,NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,miscMeas,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,stdConcentrationUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.1.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
phred,PHRED quality score,measurements,PHRED Quality Score For Sequencing,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,sequence,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
phy,Physical property,domains,"A physical property or object not characterized by life or chemistry. ",NA,phy,anySpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
physical,Physical class,classes,Measures and methods related to generic physical properties.,NA,phy,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,physical,naNomenclature,NA,NA,NA,volumeUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pK,Primary key,categories,Primary key for a table. ,All report tables have a primary key. Each row in a report table has unique identifier recorded in the primary key. ,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
plasmodium,Plasmodium,measurements,Plasmodium,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,malariaGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
pmFloMean,PMMoV- and flow-normalized mean,aggregations,Mean measure normalized to amount of PMMoV and wastewater flow.,"Mostly used for reporting specific alleles (N1, N2, E, etc.)",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
pmmovGrp,PMMoV Group,groups,A group of measures/methods related to the Pepper Mild Mottle Virus (PMMoV).,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,pmmovGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pmmovNorm,PMMoV-normalized mean,aggregations,Mean measure normalized to amount of PMMoV.,"Mostly used for reporting specific alleles (N1, N2, E, etc.)",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
pmmvABIFor,PMMV forward primer (ABI),categories,PMMV forward primer (ABI),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,pmmovGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pmmvABIProbe,PMMV probe (ABI),categories,PMMV probe (ABI),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,pmmovGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pmmvABIRev,PMMV reverse primer (ABI),categories,PMMV reverse primer (ABI),NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,pmmovGrp,pcr,naNomenclature,NA,NA,NA,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,pcrQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pop,Population,specimens,An measure or observation for a geographic area or population. ,"Examples include human compartment measures such as case numbers, hospitalization rates for diseases or surface or air compartment measures such as snow coverage or ambient temperature.",naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
po,Polygon table Shorthand,shortName,The abbreviated short name used to reference the The table that contains information about the geometry of a geographic area.,table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
pogr,Post-Grit depreciated,categories,Raw wastewater after a treatment plant's headworks.,NA,naDomain,naSpecimenSet,waterCompartmentSet,colGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,depreciated,1.0.0,2.0.0,"depreciated, site material like this is now captured in the sample table",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,0,30
policy,Policy and political sector or organization,categories,Describes organizations whose core focus is on policy or political activity.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,NA,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
polioGrp,Poliovirus Group,groups,A group of measures/methods related to polioviruses.,Used to describe the organism information for general measures.,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,polioGrp,organism,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
polygonID,Polygon ID,attributes,Unique identifier for the polygon.,A polygon is a geographic are representing the capment area of an environmental sample.,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,fK,optional,4,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,pK,mandatory,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10
polygons,Polygon table,tables,The table that contains information about the geometry of a geographic area.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,programDescr,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,58,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
polygonsOrder,Polygons table column order,tableSupport,Specifies the order of the columns in a Polygons table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,60,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,1,NA,NA,NA
polygonsRequired,Polygon table required headers,tableSupport,Specifies the columns required in a Polygons table.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,59,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
polyPop,Polygon Population,attributes,"An attribute of a polygon, which specifies the population of that polygon. A rough estimate of the number of human residents.",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,5,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
pooled,Pooled,attributes,"Is this a pooled sample, and therefore composed of multiple child samples obtained at different sites",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,14,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,boolean,NA,NA,0,30
popDateTypeDep,Type of date for case reporting depreciated,attributes,"Type of date used for confirmed cases. Typically, report or episode are reported. Onset and test date is not usually reported within aggregate data.",NA,bio,poSpecimenSet,humanCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,methodConcSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,depreciated,1.0.0,2.0.0,depreciated,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
popEq,Population equivalents,units,"A unit for measuring of design capacity for wastewater treatment plants, represented as the approximate amount of water a signle person would use.",NA,phy,siSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$pe$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure; github issue #123",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
popGrp,Population group,groups,A group of measures/methods related to population-level factors.,"Examples might be case numbers, hospitalization rates, etc.",allDo,poSpecimenSet,anyCompartmentSet,popGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
popServ,Population Served,attributes,"An attribute of a site, which specifies the population of/population served by a given site. ",NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,header,optional,15,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
populationUnitSet,Population unit set,unitSets,Unit set for hospital-related measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,humanCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,populationUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
poSaSpecimenSet,Population or sample set,specimenSets,A specimen set that inculdes population or sample specimen.,NA,naDomain,poSaSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
poSiSpecimenSet,Population or site set,specimenSets,A specimen set that inculdes population or site specimen.,NA,naDomain,poSiSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
poSpecimenSet,Population specimen set,specimenSets,A specimen set that inculdes only a population specimen.,NA,naDomain,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
postgreSQL,PostgreSQL License,categories,The licensing for the measure or data set is managed under the PostgreSQL License.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,https://choosealicense.com/licenses/postgresql/,varchar,NA,NA,0,30
pp,Percent positive,units,Percent positive of sample measures.,"Can use for Moore swabs, etc.",bio,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$\%_{pos}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,pcrQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,100,NA,NA
ppm,parts per million,units,Parts per million.,NA,phy,siSaSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$ppm$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,Input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
ppmv,PMMoV-CP,measurements,Pepper mild mottle virus capsid protein gene region,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,pmmovGrp,allele,naNomenclature,NA,NA,NA,geneticUnitSet,seeUnitAggScale,otherAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,"description wording, structure",input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,seeUnitData,seeUnitVal,seeUnitVal,NA,NA
pprt,Percent positivity rate,units,Percent positivity rate of tests conducted within a day in a given region.,NA,bio,poSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$%$,NA,naUnitSet,NA,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,now a unit for any group or biologic infection,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,NA,NA,NA
pps,Percent primary sludge,units,"Percentage of total solids, for primary sludge.",NA,phy,siSaSpecimenSet,waterCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,$\%_{primary sludge}$,NA,naUnitSet,quantAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,NA,active,1.0.0,2.0.0,description wording.,Input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,float,0,100,NA,NA
pr,Protocol relationships table Shorthand,shortName,"The abbreviated short name used to reference the The table that contains the organizational information and details (such as order) about a given protocol, recorded as a series of protocol steps (protocolSteps). ",table,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.2.2,2.2.2,added in V 2.2.2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
precipitation,Precipitation class,classes,Measures and methods related to precipitation.,NA,phy,siSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,precipitation,naNomenclature,NA,NA,NA,precipitationUnitSet,seeUnitAggScale,naAggrSet,genQualitySet,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,30
precipitationUnitSet,Precipitation unit set,unitSets,Unit set for percipitation measurements.,NA,naDomain,naSpecimenSet,anyCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,precipitationUnitSet,quantAggScale,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
preConcTemp,Storage temperature prior to concentration,measurements,The temperature at which a sample was stored between collection and concentration.,NA,phy,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,temperatureUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,-100,100,NA,NA
preConcTime,Storage time prior to concentration,measurements,Length of time for which a sample is stored between collection and concentration.,NA,phy,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,timeUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
preExtractTemp,Storage temperature prior to extraction,measurements,The temperature at which a sample was stored between concentration and extraction.,NA,phy,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,temperatureUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,-100,100,NA,NA
preExtractTime,Storage time prior to extraction,measurements,Length of time for which a sample is stored between concentration and extraction.,NA,phy,saSpecimenSet,waterCompartmentSet,procGrp,standardConc,naNomenclature,NA,NA,NA,timeUnitSet,seeUnitAggScale,linearAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,2.2.0,2.2.0,added in V2.2.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,integer,0,NA,NA,NA
pretreat,Pretreatment,measurements,Was the sample chemically treated in anyway with the addition of stabilizers or other,Pretrement method can be describe using a method. See methodID.,allDo,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,procGrp,naClass,naNomenclature,NA,NA,booleanSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,genQualitySet,genMissingnessSet,active,1.0.0,2.0.0,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,1
primer,Genetic primer,methods,Method ID used for indicating the primer used for a PCR or sequencing assay.,NA,bio,saSpecimenSet,anyCompartmentSet,measGrp,sequence,naNomenclature,NA,NA,primerSet,unitlessUnitSet,NA,naAggrSet,seqQualitySet,genMissingnessSet,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
primerSet,Genetic primer set,mmaSets,The set for genetic primers used in sequencing or PCR assays.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,primerSet,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,naUnitSet,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,categorical,NA,NA,0,30
priv,Private sector,categories,The category of organization type used for private sector or non-profit groups that are not otherwise captured by the academic category.,NA,naDomain,naSpecimenSet,naCompartmentSet,naGroup,naClass,naNomenclature,NA,NA,NA,naUnitSet,NA,naAggrSet,NA,NA,active,2.0.0,2.0.0,added in V2.0.0,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,input,NA,NA,NA,varchar,NA,NA,0,10